23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ00090 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ00090  u3 small nucleolar ribonucleoprotein protein imp3, putative  100 
 
 
196 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37810  predicted protein  63.64 
 
 
183 aa  244  4.9999999999999997e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000622727 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06171  U3 small nucleolar ribonucleoprotein subunit (Imp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08320)  54.14 
 
 
188 aa  192  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102135  normal  0.241972 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15757  predicted protein  52.27 
 
 
181 aa  189  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319753  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29359  predicted protein  47.16 
 
 
183 aa  171  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14949  normal  0.731108 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  28.97 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  27.78 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  27.59 
 
 
181 aa  61.6  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  31.68 
 
 
159 aa  51.6  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  31.68 
 
 
159 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  31.63 
 
 
159 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  32.67 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  27.33 
 
 
216 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  27.89 
 
 
184 aa  48.9  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  24.26 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  26.9 
 
 
183 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  28.3 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  27.21 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  27.27 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  25.41 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  27.21 
 
 
173 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  27.67 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  24.26 
 
 
193 aa  41.6  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>