19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15757 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_15757  predicted protein  100 
 
 
181 aa  372  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319753  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37810  predicted protein  55.8 
 
 
183 aa  211  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000622727 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29359  predicted protein  49.72 
 
 
183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14949  normal  0.731108 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06171  U3 small nucleolar ribonucleoprotein subunit (Imp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08320)  49.73 
 
 
188 aa  184  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102135  normal  0.241972 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00090  u3 small nucleolar ribonucleoprotein protein imp3, putative  52.27 
 
 
196 aa  164  8e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  25.49 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  28.93 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  37.8 
 
 
159 aa  48.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  28.4 
 
 
159 aa  47.8  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  26.09 
 
 
159 aa  47  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  26.97 
 
 
187 aa  44.7  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  22.45 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  23.08 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  28.16 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  24.53 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  24.73 
 
 
185 aa  42.4  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  23.91 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  19.73 
 
 
173 aa  42  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  27.03 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>