More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1391 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1391  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 
201 aa  417  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  61.39 
 
 
201 aa  252  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  60.89 
 
 
201 aa  240  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  55.94 
 
 
202 aa  231  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  57.43 
 
 
201 aa  231  8.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  57.92 
 
 
201 aa  230  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  56.44 
 
 
201 aa  228  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  55.45 
 
 
201 aa  226  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.95 
 
 
200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  50.99 
 
 
201 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  50.99 
 
 
201 aa  210  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  51.98 
 
 
200 aa  207  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  48.51 
 
 
200 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  49.01 
 
 
200 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 
200 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  49.5 
 
 
200 aa  177  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  49.5 
 
 
200 aa  177  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  49.5 
 
 
200 aa  177  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  49.5 
 
 
200 aa  177  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  49.5 
 
 
200 aa  177  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  49.5 
 
 
200 aa  177  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  49.5 
 
 
200 aa  177  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  49.5 
 
 
200 aa  177  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  49.5 
 
 
200 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0456  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 
208 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.189833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0517  30S ribosomal protein S4  46.89 
 
 
208 aa  175  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3885  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 
206 aa  175  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0632608  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 
206 aa  174  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  49.01 
 
 
200 aa  174  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5056  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 
206 aa  174  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00247728  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  174  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0346  ribosomal protein S4  45.45 
 
 
207 aa  173  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0507  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0166592  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  46.23 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0478  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000269214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0511  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595592  normal  0.0197267 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 
206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  171  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 
206 aa  171  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0983  SSU ribosomal protein S4P  45.67 
 
 
206 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923822  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4725  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 
206 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766159  normal  0.270309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0650  ribosomal protein S4  43.75 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4525  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815516  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06490  30S ribosomal protein S4  43.69 
 
 
206 aa  170  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 
200 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 
200 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 
206 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 
206 aa  169  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  45.24 
 
 
206 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0779  30S ribosomal protein S4  46.89 
 
 
209 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0600575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  44.17 
 
 
206 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 
206 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  45.15 
 
 
262 aa  168  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 
200 aa  168  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  168  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0347  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  167  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0772249  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00753  30S ribosomal protein S4  43.69 
 
 
206 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3798  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 
201 aa  166  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 
206 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001718  SSU ribosomal protein S4p (S9e)  43.69 
 
 
206 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000581298  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0083  30S ribosomal protein S4  43.2 
 
 
206 aa  166  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000323728  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  45.63 
 
 
206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3612  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0916894  normal  0.743877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3611  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00202112  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3719  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0332489  normal  0.162839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3976  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  46.53 
 
 
203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3684  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00775419  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0429  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  44.93 
 
 
206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3782  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.034256  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04497  30S ribosomal protein S4  46.89 
 
 
208 aa  165  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.777393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0445  SSU ribosomal protein S4P  45.19 
 
 
206 aa  165  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03147  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  44.23 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3779  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105305  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3490  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000164824  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03098  hypothetical protein  44.23 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3591  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0175638  normal  0.0749349 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4618  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000445858  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0417  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.045567  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3682  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00624205  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3727  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 
206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  hitchhiker  0.00505868 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0343  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0236416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0605  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000812639  normal  0.600341 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3891  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000651911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0307  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  41.51 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  46.95 
 
 
208 aa  162  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>