More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0938 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0938  diguanylate cyclase  100 
 
 		 541 aa  1060    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0685  diguanylate cyclase  29.69 
 
 		 548 aa  233  8.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0276799  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1776  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.59 
 
 		 547 aa  106  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4216  diguanylate cyclase  23.78 
 
 		 717 aa  60.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6404  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5832  diguanylate cyclase  29.41 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361903 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1119  diguanylate cyclase  29.77 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1435  GGDEF domain-containing protein  27.03 
 
 		 733 aa  57  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4207  GGDEF domain-containing protein  26.57 
 
 		 625 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2036  diguanylate cyclase  27.45 
 
 		 381 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0190259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3559  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 625 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0397  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 625 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1814  diguanylate cyclase  30.28 
 
 		 267 aa  54.7  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0886  diguanylate cyclase  24.71 
 
 		 391 aa  54.7  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0459194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1030  diguanylate cyclase  24.71 
 
 		 391 aa  54.7  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.12052 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0659  diguanylate cyclase  28.03 
 
 		 417 aa  54.3  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0149639  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3733  diguanylate cyclase  26.57 
 
 		 625 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2587  GGDEF domain-containing protein  25.75 
 
 		 621 aa  53.9  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21731  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1986  diguanylate cyclase  27.69 
 
 		 307 aa  53.9  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0556  diguanylate cyclase  25.93 
 
 		 314 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303867 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1863  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 368 aa  53.9  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.150647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1425  diguanylate cyclase  25 
 
 		 381 aa  53.5  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1928  diguanylate cyclase  29.79 
 
 		 365 aa  53.5  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.851461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.39 
 
 		 557 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32350  diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein  24.81 
 
 		 628 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1085  diguanylate cyclase  25 
 
 		 357 aa  53.5  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2650  diguanylate cyclase  30.47 
 
 		 347 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3452  GGDEF domain-containing protein  29.17 
 
 		 363 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  24.75 
 
 		 1346 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1412  diguanylate cyclase  22.54 
 
 		 516 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0104  diguanylate cyclase  25.95 
 
 		 307 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.851884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2535  GGDEF  29.6 
 
 		 350 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.388449  normal  0.835067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1213  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.06 
 
 		 457 aa  51.6  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2970  diguanylate cyclase  23.53 
 
 		 557 aa  52  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.853836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2989  diguanylate cyclase  25.82 
 
 		 628 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542118  normal  0.107456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1695  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.58 
 
 		 594 aa  51.2  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  27.01 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4317  ATPase domain-containing protein  22.95 
 
 		 600 aa  51.6  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0689  putative diguanylate cyclase  22.79 
 
 		 306 aa  51.2  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4161  diguanylate cyclase  31.06 
 
 		 366 aa  50.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3192  diguanylate cyclase  27.33 
 
 		 627 aa  50.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1195  GGDEF family protein  24.53 
 
 		 429 aa  50.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1817  GGDEF family protein  25.19 
 
 		 512 aa  50.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4784  GGDEF domain protein  26.98 
 
 		 366 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0952  membrane associated GGDEF protein  30.23 
 
 		 416 aa  50.8  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.343928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0679  TPR repeat-containing diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase  27.34 
 
 		 684 aa  50.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0530  response regulator receiver protein  28.14 
 
 		 392 aa  50.8  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143294  normal  0.0713478 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0498  diguanylate cyclase  25.87 
 
 		 624 aa  50.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3903  diguanylate cyclase  24.81 
 
 		 370 aa  50.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0522591 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.87 
 
 		 1505 aa  50.4  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.40172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3227  diguanylate cyclase  23.29 
 
 		 359 aa  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.709302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0747  diguanylate cyclase  26.76 
 
 		 508 aa  50.4  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4315  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25 
 
 		 554 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.554314 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1545  diguanylate cyclase  27.83 
 
 		 701 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.58352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3267  diguanylate cyclase  26.24 
 
 		 381 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  24.64 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000908772  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2003  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.55 
 
 		 770 aa  49.3  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000215856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  24.65 
 
 		 631 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.68 
 
 		 3470 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1059  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  27.69 
 
 		 570 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0093  diguanylate cyclase  27.41 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0782  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  24.64 
 
 		 450 aa  49.3  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000969424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3522  diguanylate cyclase  27.42 
 
 		 636 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.890826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0442  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.58 
 
 		 1785 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.6 
 
 		 791 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0835  diguanylate cyclase  27.97 
 
 		 443 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153525  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2195  diguanylate cyclase  23.24 
 
 		 496 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.741232  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6817  diguanylate cyclase  25.74 
 
 		 309 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0436963  normal  0.457033 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0697  diguanylate cyclase  28.24 
 
 		 264 aa  48.5  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.184616  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5883  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.57 
 
 		 516 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0454667 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2867  diguanylate cyclase  27.2 
 
 		 402 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0634  response regulator  33.33 
 
 		 470 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00145352  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0613  diguanylate cyclase  26.92 
 
 		 611 aa  48.5  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0094  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.77 
 
 		 602 aa  48.5  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1938  diguanylate cyclase  28.15 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1231  diguanylate cyclase  26.47 
 
 		 345 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0658  diguanylate cyclase  22.4 
 
 		 547 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0308  diguanylate cyclase  27.87 
 
 		 301 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.37303  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1802  diguanylate cyclase  25.78 
 
 		 263 aa  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0190  diguanylate cyclase  32.56 
 
 		 329 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3185  diguanylate cyclase  29.77 
 
 		 347 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.0939676 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2540  diguanylate cyclase  25.16 
 
 		 744 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2015  diguanylate cyclase  31.9 
 
 		 249 aa  48.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1859  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.52 
 
 		 917 aa  48.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3943  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 495 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4423  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 516 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0297  diguanylate cyclase  27.87 
 
 		 301 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2394  GGDEF domain-containing protein  30.08 
 
 		 415 aa  47.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0414  diguanylate cyclase  29.01 
 
 		 346 aa  47.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1589  diguanylate cyclase  27.42 
 
 		 538 aa  47.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4153  putative sensory box/GGDEF family protein  27.82 
 
 		 430 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36181  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1769  diguanylate cyclase  24.83 
 
 		 464 aa  47.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.128605  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1780  diguanylate cyclase  28.46 
 
 		 334 aa  47.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02110  GGDEF domain-containing protein  27.13 
 
 		 235 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.594222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2807  GGDEF domain protein  28.46 
 
 		 385 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.685296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0787  GGDEF  23.61 
 
 		 585 aa  47.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109099  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.58 
 
 		 772 aa  47.4  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.69 
 
 		 668 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3010  diguanylate cyclase  25.78 
 
 		 377 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0798808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0187  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.65 
 
 		 469 aa  47.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>