More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0886 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0886  diguanylate cyclase  100 
 
 
391 aa  798    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0459194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1030  diguanylate cyclase  100 
 
 
391 aa  798    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.12052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3686  diguanylate cyclase  36.43 
 
 
385 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3387  diguanylate cyclase  35.94 
 
 
385 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610096  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0290  diguanylate cyclase  34.94 
 
 
409 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1246  diguanylate cyclase  31.55 
 
 
440 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2736  diguanylate cyclase  30.48 
 
 
405 aa  142  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4429  diguanylate cyclase  32.15 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2441  diguanylate cyclase  30.63 
 
 
403 aa  141  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933088  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0347  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  30.28 
 
 
531 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  28.02 
 
 
405 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000814  hypothetical protein  30 
 
 
402 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4164  diguanylate cyclase  30.08 
 
 
384 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562104  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2513  diguanylate cyclase  28.72 
 
 
405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0645209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3108  diguanylate cyclase  31.58 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1902  diguanylate cyclase  39.9 
 
 
469 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000136063  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3566  diguanylate cyclase  39.39 
 
 
460 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000340192  normal  0.133927 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4776  diguanylate cyclase  29.36 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3932  GGDEF domain-containing protein  39.39 
 
 
402 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0460046  normal  0.0449819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1337  diguanylate cyclase  30.99 
 
 
427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387993  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0532  diguanylate cyclase  28.14 
 
 
400 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.457975  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3480  diguanylate cyclase  28.72 
 
 
395 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4589  diguanylate cyclase  30.87 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365756  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4122  diguanylate cyclase  28.97 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.519011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1695  GGDEF family protein  27.81 
 
 
420 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.037923  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1377  diguanylate cyclase  33.33 
 
 
368 aa  127  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3010  diguanylate cyclase  42.59 
 
 
382 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39460  guanylyl cyclase  30.03 
 
 
415 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3222  diguanylate cyclase  38.07 
 
 
469 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0257406  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3968  diguanylate cyclase  29.97 
 
 
385 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3203  diguanylate cyclase  39.9 
 
 
569 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0987619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4045  diguanylate cyclase  29.97 
 
 
385 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3752  diguanylate cyclase  37.44 
 
 
436 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  37.5 
 
 
1037 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3550  diguanylate cyclase  39.75 
 
 
381 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2709  GGDEF domain-containing protein  30.23 
 
 
411 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887365  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2021  diguanylate cyclase  42.68 
 
 
381 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3476  diguanylate cyclase  37.36 
 
 
298 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4163  diguanylate cyclase  29.44 
 
 
385 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2077  diguanylate cyclase  39.23 
 
 
382 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.793636  normal  0.406002 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0504  GGDEF domain-containing protein  29.21 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6762  diguanylate cyclase  34.91 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322015  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2693  diguanylate cyclase  42.68 
 
 
570 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2626  diguanylate cyclase  43.02 
 
 
599 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  38.73 
 
 
556 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5530  diguanylate cyclase  30.94 
 
 
384 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  39.76 
 
 
722 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2673  diguanylate cyclase  42.24 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2698  diguanylate cyclase  40.33 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.110295  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1751  diguanylate cyclase  29.24 
 
 
389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123921  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3185  diguanylate cyclase  35.8 
 
 
347 aa  120  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.0939676 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3083  diguanylate cyclase  35.53 
 
 
409 aa  120  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5832  diguanylate cyclase  38.31 
 
 
381 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  35.44 
 
 
357 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00176  diguanylate cyclase  38.75 
 
 
354 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1663  diguanylate cyclase  38.73 
 
 
491 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.31 
 
 
1466 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1181  diguanylate cyclase  42.31 
 
 
482 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0233  diguanylate cyclase  26.97 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  37.5 
 
 
418 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4255  GGDEF  35.68 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4831  diguanylate cyclase  41.61 
 
 
392 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169635  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2861  diguanylate cyclase  32.58 
 
 
421 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1304  diguanylate cyclase  42.68 
 
 
559 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1745  diguanylate cyclase  38.99 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.597218  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  41.72 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0680  diguanylate cyclase  35.98 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  39.39 
 
 
459 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4666  diguanylate cyclase  38.27 
 
 
407 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00608192  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  40.96 
 
 
360 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0723  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.88 
 
 
540 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2036  diguanylate cyclase  42.42 
 
 
381 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0190259 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0530  response regulator receiver protein  38.07 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143294  normal  0.0713478 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  40.85 
 
 
532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2593  diguanylate cyclase  39.31 
 
 
569 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0279465  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3704  diguanylate cyclase  35.98 
 
 
460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1815  diguanylate cyclase  40.49 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.404044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4428  diguanylate cyclase  30.64 
 
 
383 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3737  diguanylate cyclase  27.63 
 
 
391 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  hitchhiker  0.00976865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0489  diguanylate cyclase  26.4 
 
 
384 aa  117  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.51 
 
 
843 aa  116  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2608  diguanylate cyclase  31.98 
 
 
380 aa  116  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  40.61 
 
 
362 aa  116  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1893  hypothetical protein  41.07 
 
 
533 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0317418  normal  0.65749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2010  diguanylate cyclase  35.29 
 
 
351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1536  diguanylate cyclase  39.18 
 
 
278 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370191  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1366  diguanylate cyclase  32.92 
 
 
369 aa  116  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  37.5 
 
 
624 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0686  GGDEF/HAMP domain-containing protein  41.88 
 
 
427 aa  116  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.43 
 
 
772 aa  115  8.999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0776  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.14 
 
 
864 aa  115  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3168  diguanylate cyclase  39.63 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  37.08 
 
 
458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1554  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.65 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1914  GGDEF domain-containing protein  37.27 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.743896  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  33.49 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  38.24 
 
 
425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2429  diguanylate cyclase  36.19 
 
 
406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0271208 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2607  diguanylate cyclase  39.55 
 
 
316 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000143356  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1852  diguanylate cyclase  37.02 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0317173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>