More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1181 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1181  diguanylate cyclase  100 
 
 		 482 aa  967    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1902  diguanylate cyclase  47.45 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000136063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3566  diguanylate cyclase  46.71 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000340192  normal  0.133927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3222  diguanylate cyclase  48.44 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0257406  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3932  GGDEF domain-containing protein  46.88 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0460046  normal  0.0449819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2518  diguanylate cyclase  37.79 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.784165 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2009  diguanylate cyclase  35.43 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0406773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3478  diguanylate cyclase  34.15 
 
 		 496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.289854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1650  diguanylate cyclase  34.26 
 
 		 472 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1722  diguanylate cyclase  34.26 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2135  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  34.26 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.329432  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01479  predicted diguanylate cyclase  37.66 
 
 		 315 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01490  hypothetical protein  37.66 
 
 		 315 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1338  diguanylate cyclase  31.09 
 
 		 469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0898942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2124  diguanylate cyclase  37.14 
 
 		 315 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0045948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0540  diguanylate cyclase  31.51 
 
 		 489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2136  diguanylate cyclase  37.66 
 
 		 315 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2643  diguanylate cyclase  33.48 
 
 		 470 aa  190  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1604  diguanylate cyclase  37.99 
 
 		 279 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.608459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0757  diguanylate cyclase  29.62 
 
 		 489 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.371772  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4599  diguanylate cyclase  42.71 
 
 		 231 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.711309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4604  diguanylate cyclase  24.54 
 
 		 489 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4124  diguanylate cyclase  45.29 
 
 		 485 aa  143  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2036  diguanylate cyclase  44.04 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0190259 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5832  diguanylate cyclase  44.56 
 
 		 381 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4283  diguanylate cyclase  24.63 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  40.96 
 
 		 1037 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3753  diguanylate cyclase  39.79 
 
 		 485 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3863  diguanylate cyclase  35.38 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2218  GGDEF  43.2 
 
 		 448 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4255  GGDEF  42.19 
 
 		 400 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3428  diguanylate cyclase  41.42 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2636  diguanylate cyclase  40 
 
 		 220 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  41.81 
 
 		 499 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0379  diguanylate cyclase  40.8 
 
 		 540 aa  131  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2077  diguanylate cyclase  42.61 
 
 		 382 aa  131  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.793636  normal  0.406002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  38.74 
 
 		 485 aa  131  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0268  diguanylate cyclase  38.34 
 
 		 485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.624982  hitchhiker  0.000186113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1751  diguanylate cyclase  40.61 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123921  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3802  signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 574 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.560077  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  35.85 
 
 		 578 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2318  diguanylate cyclase  35.56 
 
 		 363 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1528  diguanylate cyclase  41.51 
 
 		 1339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.646539  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2154  GGDEF  40.46 
 
 		 411 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1851  diguanylate cyclase  37.91 
 
 		 620 aa  126  9e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4122  diguanylate cyclase  40.36 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.519011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  39.44 
 
 		 794 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1328  diguanylate cyclase  46.11 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.561523  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4209  signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 631 aa  126  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3476  diguanylate cyclase  36.55 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4589  diguanylate cyclase  40.57 
 
 		 409 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3480  diguanylate cyclase  40.36 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232889  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  41.57 
 
 		 630 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0659  diguanylate cyclase  37.13 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0149639  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.21 
 
 		 730 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1081  diguanylate cyclase  40.67 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26970  hypothetical protein  41.21 
 
 		 525 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  41.32 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2262  diguanylate cyclase  41.53 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0392628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2608  diguanylate cyclase  40.94 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  38.55 
 
 		 498 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2709  GGDEF domain-containing protein  39.31 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887365  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3362  diguanylate cyclase  41.92 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3988  two component response regulator  40.68 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  36.07 
 
 		 513 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1808  diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 247 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3374  diguanylate cyclase  40 
 
 		 492 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4658  hypothetical protein  34.83 
 
 		 818 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7359  putative diguanylate cyclase  42.2 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2173  diguanylate cyclase  38.34 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3010  diguanylate cyclase  41.52 
 
 		 382 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0093  diguanylate cyclase  38.55 
 
 		 426 aa  123  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3093  diguanylate cyclase  35.82 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2940  sensor diguanylate cyclase  37.44 
 
 		 571 aa  123  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1922  diguanylate cyclase  45.83 
 
 		 527 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.252712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  38.82 
 
 		 946 aa  123  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2146  cellulose synthesis regulatory protein  37.79 
 
 		 570 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.256949  normal  0.163286 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3628  diguanylate cyclase  36.6 
 
 		 388 aa  123  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2204  cellulose synthesis regulatory protein  37.79 
 
 		 570 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.315572  normal  0.912149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1132  cellulose synthesis regulatory protein  37.79 
 
 		 570 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1433  diguanylate cyclase  39.38 
 
 		 387 aa  123  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.58748  normal  0.153521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2150  cellulose synthesis regulatory protein  37.79 
 
 		 570 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297138  normal  0.0131316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1253  cellulose synthesis regulatory protein  37.79 
 
 		 570 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.839594 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4457  GGDEF domain-containing protein  36.65 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2195  diguanylate cyclase  33.47 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.741232  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00176  diguanylate cyclase  40.24 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2896  cellulose binding, type IV  42.51 
 
 		 443 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808862 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  36.95 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4045  diguanylate cyclase  35.37 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0785  diguanylate cyclase  39.16 
 
 		 502 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.38 
 
 		 407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  35.5 
 
 		 487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2593  diguanylate cyclase  37.22 
 
 		 569 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0279465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4901  hypothetical protein  41.04 
 
 		 375 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  43.12 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  45.29 
 
 		 689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2284  hypothetical protein  41.76 
 
 		 525 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0619167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2249  response regulator/GGDEF domain-containing protein  39.76 
 
 		 400 aa  121  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53140  hypothetical protein  34.33 
 
 		 823 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4163  diguanylate cyclase  40.59 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>