More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4831 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4831  diguanylate cyclase  100 
 
 		 392 aa  773    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3474  diguanylate cyclase  42.03 
 
 		 393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5658  putative diguanylate cyclase  34.22 
 
 		 395 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0922182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2408  diguanylate cyclase  35.03 
 
 		 427 aa  193  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0946  GGDEF domain-containing protein  33.89 
 
 		 369 aa  159  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1004  GGDEF domain-containing protein  33.89 
 
 		 369 aa  159  9e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.662201  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6915  diguanylate cyclase  44.74 
 
 		 202 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0116  diguanylate cyclase  31.12 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1296  diguanylate cyclase  30 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1471  diguanylate cyclase  38.1 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0238873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2207  diguanylate cyclase  39.61 
 
 		 735 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0556  diguanylate cyclase  48.24 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303867 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  42.4 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  42.04 
 
 		 458 aa  130  3e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1477  diguanylate cyclase  41.03 
 
 		 411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  47.77 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1938  diguanylate cyclase  34.6 
 
 		 391 aa  130  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  43.48 
 
 		 532 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0259  diguanylate cyclase  35.04 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1806  diguanylate cyclase  39.09 
 
 		 473 aa  129  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.782438  hitchhiker  0.00449211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.61 
 
 		 557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  39.01 
 
 		 611 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  40 
 
 		 532 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39460  guanylyl cyclase  43.37 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  45.22 
 
 		 556 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4417  diguanylate cyclase  37.2 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2966  diguanylate cyclase  44.83 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1762  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.27 
 
 		 1032 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  41.42 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3185  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.65 
 
 		 482 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4172  GGDEF domain-containing protein  44.59 
 
 		 431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  37.95 
 
 		 532 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  38.5 
 
 		 578 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2709  GGDEF domain-containing protein  40.53 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887365  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  41.4 
 
 		 458 aa  126  6e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1085  diguanylate cyclase  38.92 
 
 		 357 aa  126  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 758 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2091  diguanylate cyclase  34.35 
 
 		 325 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.21 
 
 		 668 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03046  GGDEF domain protein  43.23 
 
 		 518 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.21 
 
 		 668 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2044  diguanylate cyclase  34.35 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.82426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1702  diguanylate cyclase  39.41 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3621  GGDEF  31.88 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0388472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3108  diguanylate cyclase  38.22 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2067  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4589  diguanylate cyclase  38.73 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2673  diguanylate cyclase  39.39 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2544  diguanylate cyclase  39.77 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.871243  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2041  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3143  diguanylate cyclase  43.68 
 
 		 614 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.212991  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2282  diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 325 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4568  hypothetical protein  34.78 
 
 		 325 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03006  hypothetical protein  32.64 
 
 		 520 aa  123  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  44.38 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0136  diguanylate cyclase  50.32 
 
 		 288 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.041844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.18 
 
 		 772 aa  123  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3330  diguanylate cyclase  38.59 
 
 		 401 aa  123  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2880  GGDEF  44.79 
 
 		 410 aa  123  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.16195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2835  response regulator receiver domain-containing protein  37.42 
 
 		 346 aa  122  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2774  diguanylate cyclase  39.35 
 
 		 530 aa  122  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0313  diguanylate cyclase  33.72 
 
 		 577 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1742  diguanylate cyclase  43.23 
 
 		 259 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0534167  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  40.64 
 
 		 493 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2394  GGDEF domain-containing protein  36.84 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2463  hypothetical protein  40.29 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162594  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  31.13 
 
 		 574 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3648  formamidopyrimidine-DNA glycolase  36.97 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1149  diguanylate cyclase  43.56 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2926  diguanylate cyclase  41.98 
 
 		 250 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1748  diguanylate cyclase  41.94 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3711  diguanylate cyclase  33.72 
 
 		 571 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0144  diguanylate cyclase  42.51 
 
 		 642 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3968  diguanylate cyclase  32.42 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  40.64 
 
 		 493 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1546  diguanylate cyclase  39.47 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0539589  hitchhiker  0.00796281 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3752  diguanylate cyclase  40.86 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0379  diguanylate cyclase  39.66 
 
 		 540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  35.92 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3083  diguanylate cyclase  38.31 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2668  diguanylate cyclase  39.68 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4163  diguanylate cyclase  32.42 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1301  diguanylate cyclase  43.53 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298458  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2084  diguanylate cyclase  41.94 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0129  GGDEF domain-containing protein  41.92 
 
 		 645 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1323  diguanylate cyclase  35.47 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.420197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0339  GGDEF domain protein  42.42 
 
 		 677 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1056  diguanylate cyclase  45.83 
 
 		 580 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.77678  normal  0.689214 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1119  diguanylate cyclase  40.76 
 
 		 325 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  43.83 
 
 		 517 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2801  diguanylate cyclase  43.62 
 
 		 628 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.615763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.08 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2698  diguanylate cyclase  37.91 
 
 		 410 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.110295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  36.74 
 
 		 227 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2119  response regulatory protein  29.59 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4045  diguanylate cyclase  32.77 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3168  diguanylate cyclase  39.05 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0146  diguanylate cyclase  41.92 
 
 		 645 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1163  diguanylate cyclase  43.31 
 
 		 308 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>