More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0685 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0685  diguanylate cyclase  100 
 
 		 548 aa  1090    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0276799  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0938  diguanylate cyclase  29.51 
 
 		 541 aa  238  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1776  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.53 
 
 		 547 aa  115  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4216  diguanylate cyclase  22.36 
 
 		 717 aa  87  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.23 
 
 		 704 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.23 
 
 		 713 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1532  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.2 
 
 		 811 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.308961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1331  diguanylate cyclase  28.47 
 
 		 811 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.894809  normal  0.828271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.57 
 
 		 353 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.61 
 
 		 675 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  29.25 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  25.45 
 
 		 681 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0603  sensory box/GGDEF family protein  34.07 
 
 		 702 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3979  diguanylate cyclase with GAF sensor  20.31 
 
 		 567 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000058301  hitchhiker  0.000000371669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0402  diguanylate cyclase  22.41 
 
 		 866 aa  68.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  24.77 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0530  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.86 
 
 		 784 aa  68.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.22 
 
 		 823 aa  67.4  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.348272  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4789  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and MHYT sensor(s)  30.16 
 
 		 795 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08240  GGDEF domain protein  30.71 
 
 		 448 aa  67  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0456  sensory box/GGDEF family protein  33.33 
 
 		 689 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  30.28 
 
 		 405 aa  67  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.89 
 
 		 841 aa  67  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  26.64 
 
 		 471 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2318  diguanylate cyclase  30 
 
 		 363 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6762  diguanylate cyclase  29.79 
 
 		 411 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.6 
 
 		 362 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  29.13 
 
 		 513 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.59 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2312  diguanylate cyclase with GAF sensor  21.93 
 
 		 597 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  27.21 
 
 		 836 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1304  diguanylate cyclase  24.08 
 
 		 559 aa  65.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  21.65 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3486  diguanylate cyclase  27.45 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121522  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  29.14 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.71 
 
 		 853 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  25 
 
 		 1079 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  25.5 
 
 		 569 aa  65.1  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0624  sensory box/GGDEF family protein  32.54 
 
 		 689 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.91 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  22.86 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  27.21 
 
 		 792 aa  65.1  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  23.85 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1926  diguanylate cyclase  28.76 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3686  diguanylate cyclase  29.6 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6176  diguanylate cyclase  28.76 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1903  diguanylate cyclase  28.76 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.72 
 
 		 800 aa  64.7  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0426061  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6679  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.11 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  19.61 
 
 		 758 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0585  sensory box/GGDEF family protein  31.75 
 
 		 689 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0472  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.22 
 
 		 853 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000400428 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1821  diguanylate cyclase  29.37 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1891  diguanylate cyclase  29.37 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.311116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4753  sensory box/GGDEF family protein  31.25 
 
 		 689 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.410613  hitchhiker  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2168  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.77 
 
 		 831 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.273298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1695  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25 
 
 		 594 aa  63.9  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2594  diguanylate cyclase  24.62 
 
 		 582 aa  63.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3264  diguanylate cyclase  26.87 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0517  sensory box/GGDEF family protein  30.16 
 
 		 689 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0460  sensory box/GGDEF family protein  30.16 
 
 		 689 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3340  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.61 
 
 		 607 aa  63.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0109  diguanylate cyclase  26.22 
 
 		 461 aa  63.2  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00058  C-di-GMP phosphodiesterase A  27.34 
 
 		 747 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0145768  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0548  sensory box/GGDEF family protein  30.16 
 
 		 689 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1471  diguanylate cyclase  28.38 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1864  putative diguanylate cyclase  26.9 
 
 		 882 aa  63.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0141  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.55 
 
 		 795 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0947657 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1303  diguanylate cyclase  32.14 
 
 		 237 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0549  sensory box/GGDEF family protein  30.16 
 
 		 689 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7749100000000004e-26 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1630  diguanylate cyclase with GAF sensor  22.6 
 
 		 739 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0234  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.45 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  21.29 
 
 		 663 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1126  diguanylate cyclase  29.13 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1445  putative diguanylate cyclase  28.33 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0717377  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  27.41 
 
 		 799 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1182  GGDEF domain/EAL domain-containing protein  32.54 
 
 		 688 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0691  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.87 
 
 		 742 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42220  membrane sensor domain-containing protein  26.95 
 
 		 685 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3140  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.57 
 
 		 754 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0125  GGDEF domain-containing protein  25.22 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.47 
 
 		 693 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5204  diguanylate cyclase  27.45 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1426  diguanylate cyclase  25.93 
 
 		 385 aa  62  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0591  putative sensor protein  26.95 
 
 		 1121 aa  62  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3261  GGDEF domain-containing protein  28.57 
 
 		 702 aa  62  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.012427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0463  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.13 
 
 		 689 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1037  sensory box/response regulator  31.51 
 
 		 799 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4735  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.19 
 
 		 689 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0595206  normal  0.234911 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1051  diguanylate cyclase  31.45 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154093  normal  0.979636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  32.79 
 
 		 1826 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0688  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.45 
 
 		 951 aa  61.6  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00399648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0744  diguanylate cyclase  29.58 
 
 		 753 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165088  normal  0.416995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1893  hypothetical protein  30.71 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0317418  normal  0.65749 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0859  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.51 
 
 		 809 aa  61.2  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  25.45 
 
 		 609 aa  61.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3194  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.8 
 
 		 726 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.178802  normal  0.0329837 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1371  diguanylate cyclase  27.45 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4460  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.71 
 
 		 709 aa  61.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200253  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.29 
 
 		 1078 aa  61.2  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>