More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1776 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1776  diguanylate cyclase with GAF sensor  100 
 
 		 547 aa  1093    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4216  diguanylate cyclase  29.53 
 
 		 717 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0685  diguanylate cyclase  26.88 
 
 		 548 aa  134  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0276799  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0938  diguanylate cyclase  27.59 
 
 		 541 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1619  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  31.65 
 
 		 632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.702165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.98 
 
 		 557 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1669  diguanylate cyclase  34.57 
 
 		 499 aa  107  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.96 
 
 		 781 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.015368  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0627  diguanylate cyclase  40.27 
 
 		 1052 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.256226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1750  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  30.09 
 
 		 896 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.42554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  31.43 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.81 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.69 
 
 		 1073 aa  105  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  30.8 
 
 		 509 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2169  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.47 
 
 		 722 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0648584  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3903  diguanylate cyclase  37.35 
 
 		 370 aa  104  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0522591 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3978  diguanylate cyclase  39.24 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3864  diguanylate cyclase  39.24 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315138  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1484  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.67 
 
 		 555 aa  103  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2393  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.72 
 
 		 455 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 414 aa  103  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0600  response regulator receiver protein  31.96 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1566  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.92 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3125  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.65 
 
 		 712 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  24.4 
 
 		 758 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  32.98 
 
 		 794 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1905  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.2 
 
 		 884 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.39821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3010  diguanylate cyclase  34.88 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0796  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.55 
 
 		 765 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.341606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0267  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.32 
 
 		 500 aa  102  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3234  diguanylate cyclase  35.56 
 
 		 295 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with FHA and GAF sensor  32.72 
 
 		 880 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  33.15 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  34.57 
 
 		 674 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1471  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.92 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1877  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.84 
 
 		 722 aa  101  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2876  diguanylate cyclase  36.53 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0622  GGDEF family protein  32.26 
 
 		 489 aa  100  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.63 
 
 		 499 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1760  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.69 
 
 		 473 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.554911  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2133  GGDEF family protein  32.18 
 
 		 332 aa  100  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.352584  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  35.09 
 
 		 512 aa  100  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2212  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.78 
 
 		 543 aa  100  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4172  GGDEF domain-containing protein  34.81 
 
 		 431 aa  100  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  32.62 
 
 		 609 aa  100  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.05 
 
 		 550 aa  100  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2104  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.49 
 
 		 546 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0835719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0392  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.32 
 
 		 888 aa  99.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.301142  normal  0.0507788 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2127  response regulator  29.38 
 
 		 544 aa  99.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.08 
 
 		 780 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  28.85 
 
 		 353 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0096  diguanylate cyclase  32.97 
 
 		 555 aa  99.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1219  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.58 
 
 		 792 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3290  diguanylate cyclase  30.98 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228847  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0219  hypothetical protein  36.08 
 
 		 292 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  32.62 
 
 		 709 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1227  diguanylate cyclase  32.73 
 
 		 554 aa  99  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.594022  normal  0.072002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1689  diguanylate cyclase  30.27 
 
 		 574 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1078  diguanylate cyclase  33.73 
 
 		 507 aa  99  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  27.65 
 
 		 732 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2358  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.04 
 
 		 546 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0694  diguanylate cyclase  30.29 
 
 		 536 aa  98.6  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2008  diguanylate cyclase  30.27 
 
 		 574 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2087  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.21 
 
 		 544 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1887  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.21 
 
 		 544 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2842  diguanylate cyclase  29.17 
 
 		 785 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1158  diguanylate cyclase  33.73 
 
 		 507 aa  98.6  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1523  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.46 
 
 		 472 aa  97.8  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08240  GGDEF domain protein  30.54 
 
 		 448 aa  98.2  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2615  GGDEF domain-containing protein  32.57 
 
 		 294 aa  97.8  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0556  diguanylate cyclase  32.93 
 
 		 314 aa  98.2  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2241  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.11 
 
 		 546 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1189  diguanylate cyclase  34.64 
 
 		 357 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0106637  normal  0.54324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1885  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.27 
 
 		 558 aa  97.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1949  diguanylate cyclase  30.41 
 
 		 733 aa  97.4  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2118  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.67 
 
 		 546 aa  97.4  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2801  diguanylate cyclase  31.16 
 
 		 628 aa  97.4  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.615763  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0219  hypothetical protein  34.81 
 
 		 292 aa  97.1  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0689  diguanylate cyclase  27.67 
 
 		 413 aa  97.1  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.427043  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1694  diguanylate cyclase  31.07 
 
 		 431 aa  97.1  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  29.55 
 
 		 374 aa  97.1  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2470  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.26 
 
 		 756 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.578353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0634  response regulator  34.71 
 
 		 470 aa  96.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00145352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1177  two component signal transduction response regulator  32.57 
 
 		 470 aa  96.3  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1928  diguanylate cyclase  30.27 
 
 		 365 aa  96.3  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.851461 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  25.33 
 
 		 608 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02522  putative diguanylate cyclase/phosphodiesterase (GGDEF & EAL domains) with PAS/PAC sensor(s) and Response Regulator  38.75 
 
 		 427 aa  96.3  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3319  sensory box protein  35 
 
 		 733 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0228  diguanylate cyclase  29.83 
 
 		 475 aa  95.9  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.697519 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3550  diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 381 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  28.44 
 
 		 356 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  33.12 
 
 		 457 aa  95.9  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0128  diguanylate cyclase  36.53 
 
 		 636 aa  95.9  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.308364  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2050  diguanylate cyclase  33.99 
 
 		 523 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3369  diguanylate cyclase  37.66 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1412  diguanylate cyclase  33.94 
 
 		 516 aa  95.9  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1425  diguanylate cyclase  27.38 
 
 		 424 aa  95.9  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0602  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.14 
 
 		 451 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1155  diguanylate cyclase  33.99 
 
 		 357 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0422  diguanylate cyclase AdrA  26.95 
 
 		 370 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>