More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0128 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0128  diguanylate cyclase  100 
 
 
636 aa  1264    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.308364  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0759  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  51.26 
 
 
718 aa  311  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3370  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.61 
 
 
860 aa  240  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.742202  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2805  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  32.22 
 
 
878 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0866778 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0528  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  31.13 
 
 
858 aa  221  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1933  sensory box protein  39.09 
 
 
692 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0364295  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1864  putative diguanylate cyclase  37.15 
 
 
882 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3437  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.19 
 
 
684 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3451  GGDEF family protein  27.92 
 
 
909 aa  178  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0437  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.5 
 
 
659 aa  177  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1297  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.47 
 
 
891 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.112988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2016  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.97 
 
 
874 aa  174  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2048  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  52.1 
 
 
827 aa  173  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589876  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2237  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  47.83 
 
 
556 aa  173  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1075  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.88 
 
 
758 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.469487  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3052  GGDEF  48.91 
 
 
523 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.927179  normal  0.0159246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3975  GGDEF  51.11 
 
 
523 aa  170  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.456822  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0689  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.27 
 
 
723 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.452404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3355  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 
685 aa  168  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162851  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1116  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  49.19 
 
 
494 aa  167  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.464201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2016  sensory box/GGDEF family protein  45.96 
 
 
799 aa  167  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  44.57 
 
 
947 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1184  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.11 
 
 
738 aa  164  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3492  diguanylate cyclase  43.01 
 
 
474 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3543  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.78 
 
 
659 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0638  diguanylate cyclase  45.03 
 
 
737 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_003296  RS00808  hypothetical protein  44.67 
 
 
578 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2629  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.16 
 
 
821 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000585262  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.26 
 
 
768 aa  162  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  35.38 
 
 
1653 aa  161  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3192  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.37 
 
 
736 aa  161  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3241  diguanylate cyclase  47.16 
 
 
572 aa  161  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0207551  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2003  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.36 
 
 
770 aa  160  6e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000215856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0987  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.13 
 
 
739 aa  160  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000757549  decreased coverage  0.00276789 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1897  diguanylate cyclase  53.42 
 
 
937 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0415273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0581  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.93 
 
 
659 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0633  diguanylate cyclase  33.89 
 
 
302 aa  160  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.4362  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1329  diguanylate cyclase  49.43 
 
 
565 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2281  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.28 
 
 
450 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3488  diguanylate cyclase  33.56 
 
 
302 aa  159  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.464189  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3372  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.75 
 
 
659 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.13 
 
 
1471 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2637  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.35 
 
 
678 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.5465  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3606  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.86 
 
 
757 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1999  GGDEF domain-containing protein  40.2 
 
 
292 aa  158  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1354  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.16 
 
 
771 aa  158  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  43.55 
 
 
1515 aa  158  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0796  GGDEF family protein  33.33 
 
 
303 aa  158  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  29.23 
 
 
955 aa  158  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2534  sensory box/response regulator  39.17 
 
 
452 aa  158  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.26 
 
 
1508 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1446  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  46.99 
 
 
698 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  44.26 
 
 
1508 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.55 
 
 
1504 aa  157  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  44.26 
 
 
1508 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  44.26 
 
 
1508 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  42.33 
 
 
429 aa  157  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.55 
 
 
1505 aa  157  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.55 
 
 
1504 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.6 
 
 
664 aa  157  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1934  diguanylate cyclase  46.99 
 
 
937 aa  157  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0766434  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1119  diguanylate cyclase  35.76 
 
 
325 aa  156  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1952  diguanylate cyclase  52.17 
 
 
937 aa  156  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.105215  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1797  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.77 
 
 
324 aa  156  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.504833  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1075  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  45.35 
 
 
505 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0693  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.1 
 
 
664 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.1 
 
 
664 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2785  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.59 
 
 
648 aa  156  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3694  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.1 
 
 
664 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4752  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.81 
 
 
652 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.724915 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.81 
 
 
652 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.864277  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2937  signal transduction protein  44.62 
 
 
1141 aa  156  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.85 
 
 
1466 aa  156  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3320  diguanylate cyclase  33.56 
 
 
302 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2081  diguanylate cyclase  52.8 
 
 
937 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0379355  normal  0.0338945 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1343  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.74 
 
 
859 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0844288  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1166  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.63 
 
 
780 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2185  diguanylate cyclase  48.45 
 
 
941 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.260855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.26 
 
 
1511 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3018  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.55 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.89 
 
 
705 aa  154  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263072  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2434  extracellular solute-binding protein  50.31 
 
 
937 aa  154  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0645  diguanylate cyclase  33.45 
 
 
302 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3597  diguanylate cyclase  33.45 
 
 
302 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1578  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.36 
 
 
631 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3786  diguanylate cyclase  33.45 
 
 
302 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3494  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.1 
 
 
729 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.59 
 
 
925 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2113  extracellular solute-binding protein  45.6 
 
 
955 aa  154  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  44.06 
 
 
808 aa  154  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  49.2 
 
 
1101 aa  153  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1546  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.41 
 
 
1098 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2725  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.35 
 
 
717 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.172089 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.74 
 
 
1238 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2308  diguanylate cyclase  49.69 
 
 
928 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00466975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2044  sensory box/GGDEF family protein  43.26 
 
 
762 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2315  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.37 
 
 
458 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5522  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  50.6 
 
 
1076 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2039  diguanylate cyclase  43.93 
 
 
432 aa  152  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000319282  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3626  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.85 
 
 
840 aa  152  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>