More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1412 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1158  diguanylate cyclase  76.22 
 
 		 507 aa  752    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1412  diguanylate cyclase  100 
 
 		 516 aa  1041    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1078  diguanylate cyclase  76.02 
 
 		 507 aa  751    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329883  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0005  diguanylate cyclase  58.46 
 
 		 520 aa  593  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3868  diguanylate cyclase  50.88 
 
 		 517 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0787  GGDEF  39.32 
 
 		 585 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109099  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3978  diguanylate cyclase  51.99 
 
 		 448 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3864  diguanylate cyclase  51.99 
 
 		 448 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315138  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5031  diguanylate cyclase  40.23 
 
 		 532 aa  336  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3143  diguanylate cyclase  47.83 
 
 		 614 aa  310  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.212991  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1589  diguanylate cyclase  38.48 
 
 		 538 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0039  diguanylate cyclase  34.56 
 
 		 521 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2626  diguanylate cyclase  38.84 
 
 		 599 aa  252  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03378  Putative signal protein with GGDEF domain  37.6 
 
 		 510 aa  249  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3754  diguanylate cyclase  38.32 
 
 		 512 aa  236  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2716  diguanylate cyclase  35.8 
 
 		 636 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2856  GGDEF domain-containing protein  35.87 
 
 		 568 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2157  diguanylate cyclase  42.47 
 
 		 559 aa  143  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  hitchhiker  0.000000586134 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0304  diguanylate cyclase  30.96 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3973  hypothetical protein  32.56 
 
 		 355 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02658  GGDEF domain protein  40.48 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  33.86 
 
 		 354 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1477  diguanylate cyclase  40.76 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6286  GGDEF domain-containing protein  33.23 
 
 		 668 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2986  diguanylate cyclase  29.97 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2754  diguanylate cyclase  29.75 
 
 		 355 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0798314  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2652  diguanylate cyclase  41.8 
 
 		 559 aa  136  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72420  GGDEF domain-containing protein  32.3 
 
 		 671 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0411466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0686  GGDEF/HAMP domain-containing protein  39.43 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  33.9 
 
 		 354 aa  134  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  41.94 
 
 		 696 aa  134  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2462  GGDEF domain-containing protein  28.32 
 
 		 355 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.118701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0266  GGDEF  34.8 
 
 		 690 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3835  diguanylate cyclase  42.37 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  40.94 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4293  GGDEF domain-containing protein  37.97 
 
 		 334 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0725016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3203  diguanylate cyclase  40.88 
 
 		 569 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0987619 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2518  diguanylate cyclase  42.22 
 
 		 372 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.165269  normal  0.0137006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2165  diguanylate cyclase  30.73 
 
 		 460 aa  131  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1169  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.81 
 
 		 308 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.81 
 
 		 308 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1128  diguanylate cyclase  40.21 
 
 		 563 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2834  diguanylate cyclase  31.56 
 
 		 355 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0567  diguanylate cyclase  41.04 
 
 		 377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1156  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.47 
 
 		 469 aa  130  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.68 
 
 		 772 aa  130  6e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1821  diguanylate cyclase  39.27 
 
 		 466 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1891  diguanylate cyclase  39.27 
 
 		 466 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.311116  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5204  diguanylate cyclase  39.69 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1926  diguanylate cyclase  38.74 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6176  diguanylate cyclase  38.74 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1903  diguanylate cyclase  38.74 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0157  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.12 
 
 		 917 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0339  GGDEF domain protein  34.88 
 
 		 677 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3384  diguanylate cyclase  40.21 
 
 		 563 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  41.04 
 
 		 405 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1290  diguanylate cyclase  31.85 
 
 		 353 aa  128  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.86 
 
 		 916 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  38.71 
 
 		 611 aa  128  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0712  diguanylate cyclase  24.73 
 
 		 523 aa  127  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1834  diguanylate cyclase  35.19 
 
 		 525 aa  127  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.245567  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1371  diguanylate cyclase  39.69 
 
 		 466 aa  127  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2951  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.67 
 
 		 306 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0076  GGDEF domain-containing protein  24.65 
 
 		 524 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.790276  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03046  GGDEF domain protein  30.74 
 
 		 518 aa  126  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0652  diguanylate cyclase  37.93 
 
 		 280 aa  126  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1814  diguanylate cyclase  36.28 
 
 		 267 aa  126  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.68 
 
 		 901 aa  126  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1332  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.22 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  42.59 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  39.13 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2748  diguanylate cyclase  29.62 
 
 		 352 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246546  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.65 
 
 		 557 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0674  diguanylate cyclase  41.01 
 
 		 355 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3621  GGDEF  39.38 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0388472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.18 
 
 		 791 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2884  diguanylate cyclase  40.72 
 
 		 316 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000365079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3843  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.73 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000804532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1914  GGDEF domain-containing protein  35.78 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.743896  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1199  diguanylate cyclase  40.7 
 
 		 258 aa  125  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2774  diguanylate cyclase  34.6 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2154  GGDEF  40.88 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  43.64 
 
 		 650 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  45.51 
 
 		 565 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0884  diguanylate cyclase  41.04 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.576242  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1433  diguanylate cyclase  35.12 
 
 		 387 aa  125  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.58748  normal  0.153521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3254  diguanylate cyclase  34.87 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00411067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4122  diguanylate cyclase  40.59 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.519011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0541  diguanylate cyclase  38.95 
 
 		 285 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0457  diguanylate cyclase  32.89 
 
 		 349 aa  124  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3374  diguanylate cyclase  43.4 
 
 		 492 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1663  diguanylate cyclase  43.95 
 
 		 491 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  39.13 
 
 		 418 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3480  diguanylate cyclase  40.59 
 
 		 395 aa  124  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3770  PAS:GGDEF  40.21 
 
 		 328 aa  124  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0223226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0162  diguanylate cyclase  39.36 
 
 		 614 aa  124  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2556  GGDEF domain-containing protein  35.12 
 
 		 518 aa  124  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  35.43 
 
 		 378 aa  124  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0261  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.08 
 
 		 463 aa  123  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.3078  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  36.26 
 
 		 339 aa  123  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>