More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2540 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1554  GGDEF domain-containing protein  49.79 
 
 		 729 aa  701    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00526113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1467  diguanylate cyclase  50.57 
 
 		 722 aa  723    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2788  diguanylate cyclase  48.18 
 
 		 726 aa  682    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.282948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1435  GGDEF domain-containing protein  51.38 
 
 		 733 aa  762    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1805  diguanylate cyclase  51.4 
 
 		 725 aa  770    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2243  diguanylate cyclase  64.97 
 
 		 726 aa  987    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0252509  normal  0.0700768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2578  diguanylate cyclase  97.72 
 
 		 744 aa  1469    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2315  diguanylate cyclase  65.1 
 
 		 726 aa  989    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000640659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1545  diguanylate cyclase  48.15 
 
 		 701 aa  731    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.58352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2540  diguanylate cyclase  100 
 
 		 744 aa  1527    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1806  diguanylate cyclase  97.85 
 
 		 744 aa  1475    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621325 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1761  diguanylate cyclase  51.19 
 
 		 720 aa  741    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2655  diguanylate cyclase  99.46 
 
 		 744 aa  1519    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.714483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2435  diguanylate cyclase  65.24 
 
 		 726 aa  979    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.718837  normal  0.768568 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4941  sensory box protein  34.42 
 
 		 633 aa  337  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  26.37 
 
 		 574 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  39.41 
 
 		 630 aa  136  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3627  diguanylate cyclase  25.31 
 
 		 526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1174  GGDEF domain-containing protein  39.63 
 
 		 431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 498 aa  132  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0793  diguanylate cyclase  30.11 
 
 		 305 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  38.65 
 
 		 629 aa  130  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3671  putative signaling protein  27.79 
 
 		 480 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0365  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.22 
 
 		 308 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 565 aa  130  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3816  diguanylate cyclase  25.3 
 
 		 526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0204  diguanylate cyclase  34.84 
 
 		 453 aa  129  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.209858  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  39.29 
 
 		 339 aa  126  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  37.88 
 
 		 588 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0799  diguanylate cyclase  37.24 
 
 		 538 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0186826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  36.07 
 
 		 935 aa  126  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1305  diguanylate cyclase  37.88 
 
 		 256 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 611 aa  125  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3783  sensory transduction system, regulatory protein  37.63 
 
 		 546 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4149  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 591 aa  125  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0015025  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  33.8 
 
 		 794 aa  124  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2999  diguanylate cyclase  31.56 
 
 		 548 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1622  response regulator receiver protein  38.42 
 
 		 641 aa  124  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.923164  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1425  diguanylate cyclase  38.62 
 
 		 381 aa  124  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0453  GGDEF domain-containing protein  33.2 
 
 		 641 aa  124  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  29.44 
 
 		 591 aa  124  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0414  diguanylate cyclase  39.49 
 
 		 346 aa  124  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  32.12 
 
 		 556 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0429  diguanylate cyclase  37.04 
 
 		 469 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01583  Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  35.15 
 
 		 477 aa  123  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  32.44 
 
 		 624 aa  122  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  35.61 
 
 		 565 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0259  diguanylate cyclase  40.83 
 
 		 339 aa  121  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2495  diguanylate cyclase  36.92 
 
 		 422 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  34.13 
 
 		 487 aa  121  6e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2205  diguanylate cyclase  36.19 
 
 		 400 aa  120  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3800  diguanylate cyclase  36.6 
 
 		 621 aa  120  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1328  diguanylate cyclase  37.21 
 
 		 564 aa  120  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0263917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  37.82 
 
 		 547 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1927  diguanylate cyclase  39.64 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.949533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  32.62 
 
 		 636 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4407  GGDEF family protein  38.97 
 
 		 344 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4104  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.147884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1440  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.89 
 
 		 315 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0301186  normal  0.059237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  37.37 
 
 		 638 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  36.08 
 
 		 949 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2439  diguanylate cyclase  34.72 
 
 		 698 aa  118  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5323  diguanylate cyclase  35.64 
 
 		 422 aa  118  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.666672  normal  0.745062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3550  diguanylate cyclase  28.36 
 
 		 559 aa  119  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953301  normal  0.354246 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  38.92 
 
 		 555 aa  119  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3559  diguanylate cyclase  38.42 
 
 		 625 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0397  diguanylate cyclase  38.42 
 
 		 625 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1193  diguanylate cyclase  41.05 
 
 		 353 aa  118  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4825  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 435 aa  119  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.741722  normal  0.390136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0095  putative sensory transduction system, regulatory protein  38.5 
 
 		 536 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.348008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4218  diguanylate cyclase  35.96 
 
 		 631 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0093  diguanylate cyclase  38.95 
 
 		 426 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2835  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 346 aa  118  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4207  GGDEF domain-containing protein  37.44 
 
 		 625 aa  117  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 631 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1846  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37 
 
 		 314 aa  117  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  35.47 
 
 		 1034 aa  117  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.26 
 
 		 308 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.78 
 
 		 301 aa  117  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3819  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.74 
 
 		 660 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3733  diguanylate cyclase  37.93 
 
 		 625 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1546  diguanylate cyclase  44.13 
 
 		 416 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0539589  hitchhiker  0.00796281 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1614  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36 
 
 		 531 aa  117  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.423577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3770  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.74 
 
 		 660 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2588  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 568 aa  117  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4904  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.18 
 
 		 642 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0484368  normal  0.638753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0467  diguanylate cyclase  38 
 
 		 641 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2841  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.13 
 
 		 342 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0625712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.89 
 
 		 505 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4814  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.18 
 
 		 628 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  31.75 
 
 		 612 aa  116  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2699  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 251 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3362  diguanylate cyclase  39.29 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.46 
 
 		 337 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  37.7 
 
 		 1726 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1814  diguanylate cyclase  41.04 
 
 		 267 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1540  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.59 
 
 		 342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.918796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0754  diguanylate cyclase  34.34 
 
 		 350 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3737  diguanylate cyclase  40 
 
 		 391 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  hitchhiker  0.00976865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0498  diguanylate cyclase  36.45 
 
 		 624 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>