More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4625 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 753 aa  1550    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  42.38 
 
 		 792 aa  597  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  43.72 
 
 		 766 aa  593  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  41.9 
 
 		 738 aa  538  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  41.9 
 
 		 738 aa  538  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  38.79 
 
 		 777 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 747 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  38.2 
 
 		 768 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  37.12 
 
 		 765 aa  439  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  37.92 
 
 		 768 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  35.67 
 
 		 799 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 777 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 772 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 814 aa  343  7e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 835 aa  241  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 796 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 762 aa  205  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 791 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  25.17 
 
 		 760 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  24.64 
 
 		 760 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 772 aa  188  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 768 aa  185  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 815 aa  183  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 747 aa  179  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 781 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 780 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 790 aa  167  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 746 aa  164  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 782 aa  163  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  21.62 
 
 		 808 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 786 aa  139  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.6 
 
 		 766 aa  135  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 798 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 792 aa  121  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 828 aa  114  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  23.27 
 
 		 730 aa  109  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 729 aa  108  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  21.3 
 
 		 740 aa  100  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  22.84 
 
 		 781 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  22.14 
 
 		 734 aa  99.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  23.87 
 
 		 740 aa  94.4  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  20.86 
 
 		 711 aa  93.2  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 754 aa  89.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 754 aa  89.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 792 aa  87.8  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  20.66 
 
 		 741 aa  86.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 765 aa  85.1  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 841 aa  84.7  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 735 aa  82.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 735 aa  82.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 756 aa  83.2  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 786 aa  81.3  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 796 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  20.8 
 
 		 742 aa  77.8  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 796 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 790 aa  76.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 707 aa  75.5  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 702 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 702 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  24.95 
 
 		 796 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 766 aa  73.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 736 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 796 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 725 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 778 aa  70.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 725 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 710 aa  70.5  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 782 aa  69.7  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1210  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000130069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  26.71 
 
 		 730 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 790 aa  67.8  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 713 aa  67.8  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.3 
 
 		 724 aa  67.8  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 809 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 749 aa  66.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.24 
 
 		 713 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.53 
 
 		 713 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  27.09 
 
 		 719 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  27.09 
 
 		 719 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 781 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.98 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  27.09 
 
 		 752 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 694 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 809 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  25.45 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  26.22 
 
 		 730 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  23.51 
 
 		 706 aa  64.3  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  23.51 
 
 		 706 aa  64.3  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 721 aa  64.3  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  23.23 
 
 		 731 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 774 aa  64.3  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 696 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  25.07 
 
 		 809 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 		 736 aa  63.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  23.16 
 
 		 714 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  23.16 
 
 		 677 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 809 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 726 aa  63.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 713 aa  63.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>