More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1291 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  65.08 
 
 		 1188 aa  1107    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  56.99 
 
 		 1181 aa  997    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  53.62 
 
 		 1195 aa  989    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  40.68 
 
 		 1225 aa  739    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  93.41 
 
 		 1198 aa  2006    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  41.93 
 
 		 1172 aa  691    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  49.83 
 
 		 1217 aa  892    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  56.04 
 
 		 1191 aa  1050    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  58.77 
 
 		 1183 aa  1063    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  57.45 
 
 		 1224 aa  1187    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  62.36 
 
 		 1199 aa  1246    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  56.16 
 
 		 1195 aa  1052    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  55.76 
 
 		 1217 aa  1065    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  55.39 
 
 		 1227 aa  1035    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1198 aa  2312    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  55.58 
 
 		 1222 aa  1018    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  55.14 
 
 		 1203 aa  969    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  53.88 
 
 		 1213 aa  969    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  55.87 
 
 		 1191 aa  995    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  62.03 
 
 		 1194 aa  1291    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  54.93 
 
 		 1205 aa  1021    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  56.06 
 
 		 1195 aa  1051    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  57.5 
 
 		 1186 aa  1004    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  55.86 
 
 		 1214 aa  1057    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  55.53 
 
 		 1194 aa  1077    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  66.92 
 
 		 1191 aa  1412    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  54.2 
 
 		 1222 aa  1046    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  54.94 
 
 		 1194 aa  1050    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  57.11 
 
 		 1188 aa  1017    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  56.72 
 
 		 1188 aa  1134    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  56.06 
 
 		 1195 aa  1051    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  56.46 
 
 		 1194 aa  1075    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  56.11 
 
 		 1234 aa  562  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32.55 
 
 		 1187 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  72.46 
 
 		 1218 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.17 
 
 		 1190 aa  489  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  33.73 
 
 		 1179 aa  486  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  29.14 
 
 		 1185 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  52.66 
 
 		 1263 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.88 
 
 		 1185 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  28.55 
 
 		 1189 aa  435  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.77 
 
 		 1174 aa  436  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.37 
 
 		 1176 aa  429  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.71 
 
 		 1191 aa  426  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  32.63 
 
 		 1199 aa  423  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.39 
 
 		 1176 aa  422  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  32.34 
 
 		 1199 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  32.34 
 
 		 1199 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.04 
 
 		 1177 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.64 
 
 		 1176 aa  415  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.56 
 
 		 1204 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.91 
 
 		 1184 aa  394  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  26.5 
 
 		 1148 aa  394  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  29.11 
 
 		 1179 aa  388  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.75 
 
 		 1177 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.16 
 
 		 1178 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  31.65 
 
 		 1201 aa  353  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.41 
 
 		 1181 aa  350  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  28.38 
 
 		 1167 aa  325  4e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  28.38 
 
 		 1167 aa  324  8e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  28.83 
 
 		 1167 aa  316  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  28.79 
 
 		 1167 aa  315  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.48 
 
 		 1164 aa  305  4.0000000000000003e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.46 
 
 		 1170 aa  302  3e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  32.69 
 
 		 1198 aa  298  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  32.18 
 
 		 1186 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  30.6 
 
 		 1154 aa  295  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  36.38 
 
 		 1185 aa  291  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  33.12 
 
 		 1189 aa  289  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  54.65 
 
 		 1184 aa  288  4e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  30.59 
 
 		 1154 aa  288  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.79 
 
 		 1196 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  35.93 
 
 		 1174 aa  284  6.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31.2 
 
 		 1189 aa  282  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  31.33 
 
 		 1189 aa  280  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.61 
 
 		 1403 aa  277  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28.35 
 
 		 1134 aa  277  9e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  56.07 
 
 		 1187 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.86 
 
 		 1174 aa  276  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.91 
 
 		 1171 aa  272  4e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.35 
 
 		 1189 aa  270  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  49.59 
 
 		 1185 aa  263  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  23.05 
 
 		 1189 aa  261  6e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  23.06 
 
 		 1189 aa  259  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.73 
 
 		 1188 aa  256  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.73 
 
 		 1188 aa  256  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  38.48 
 
 		 1301 aa  256  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  56.81 
 
 		 1189 aa  254  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  56.81 
 
 		 1189 aa  254  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  49.02 
 
 		 1190 aa  254  7e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.2 
 
 		 1185 aa  254  7e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  56.34 
 
 		 1189 aa  254  8.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  56.34 
 
 		 1189 aa  254  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  56.34 
 
 		 1189 aa  254  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  56.34 
 
 		 1189 aa  254  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  56.34 
 
 		 1189 aa  254  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  52.58 
 
 		 1187 aa  253  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  57.84 
 
 		 1187 aa  252  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  42.61 
 
 		 1177 aa  248  4e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  23.17 
 
 		 1184 aa  247  8e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>