256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0632 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  841    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  49.62 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  50.51 
 
 		 415 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  50.63 
 
 		 433 aa  312  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  36.55 
 
 		 408 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 		 422 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  36.7 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  36.7 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  35.5 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 425 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 387 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  31.3 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  30.5 
 
 		 402 aa  122  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  30.5 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  30.13 
 
 		 416 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 399 aa  113  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 391 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  30 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 387 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 430 aa  94  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  38.22 
 
 		 216 aa  93.2  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  27.94 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  26.97 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 369 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  28.41 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  34.3 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  26.53 
 
 		 452 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  25.52 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  24.66 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  25.12 
 
 		 500 aa  73.2  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 400 aa  67  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  25.9 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  29.84 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  24.33 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 417 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  26.61 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>