More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5780 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  100 
 
 		 884 aa  1709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  46.86 
 
 		 884 aa  552  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  43.35 
 
 		 909 aa  507  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 928 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  41.79 
 
 		 919 aa  442  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  38.34 
 
 		 913 aa  352  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  35.01 
 
 		 911 aa  314  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  34.41 
 
 		 913 aa  295  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  35.18 
 
 		 929 aa  286  8e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  35.89 
 
 		 938 aa  283  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  35.63 
 
 		 879 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 		 903 aa  278  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  34.9 
 
 		 923 aa  274  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  34.42 
 
 		 928 aa  274  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  34.75 
 
 		 919 aa  270  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  31.9 
 
 		 917 aa  251  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  34.7 
 
 		 936 aa  250  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  44.44 
 
 		 928 aa  244  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  45.29 
 
 		 920 aa  234  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  32.67 
 
 		 995 aa  233  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  46.52 
 
 		 940 aa  231  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  41.86 
 
 		 930 aa  229  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 889 aa  225  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 919 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  31.94 
 
 		 919 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 925 aa  224  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  31.63 
 
 		 919 aa  220  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 937 aa  217  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  44.06 
 
 		 937 aa  217  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  43.8 
 
 		 937 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 		 923 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  42.09 
 
 		 918 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 927 aa  200  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  32.08 
 
 		 929 aa  184  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  35.67 
 
 		 934 aa  183  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  39.84 
 
 		 892 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  37.23 
 
 		 946 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  35.77 
 
 		 955 aa  174  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  39.89 
 
 		 905 aa  169  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 940 aa  165  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  34.44 
 
 		 953 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  39.33 
 
 		 913 aa  163  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  48.4 
 
 		 240 aa  162  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  36.48 
 
 		 922 aa  160  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  29.17 
 
 		 923 aa  159  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  34.26 
 
 		 916 aa  154  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  34.29 
 
 		 961 aa  148  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  34.57 
 
 		 923 aa  146  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  35.15 
 
 		 910 aa  134  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  38.9 
 
 		 1064 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  48.75 
 
 		 929 aa  119  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 919 aa  119  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  38.65 
 
 		 927 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  40.17 
 
 		 915 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  33.24 
 
 		 916 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  37.13 
 
 		 921 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 921 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  37.13 
 
 		 921 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  33.54 
 
 		 977 aa  107  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 927 aa  103  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 1000 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  41.62 
 
 		 894 aa  97.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  36.96 
 
 		 921 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 236 aa  94  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 950 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 894 aa  92  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  48.59 
 
 		 904 aa  91.3  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.72 
 
 		 947 aa  87.4  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  28.28 
 
 		 918 aa  85.9  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  33.52 
 
 		 940 aa  85.5  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 910 aa  85.1  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  38.64 
 
 		 893 aa  82.4  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  45.59 
 
 		 959 aa  82.8  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 189 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 		 872 aa  79.7  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  45.87 
 
 		 946 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 		 835 aa  77.8  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 		 948 aa  76.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  33.47 
 
 		 900 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  33.92 
 
 		 541 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 997 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.33 
 
 		 992 aa  74.7  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 998 aa  73.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  36.81 
 
 		 932 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.14 
 
 		 1150 aa  73.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  43.01 
 
 		 953 aa  71.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  27.06 
 
 		 1050 aa  70.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.06 
 
 		 1050 aa  70.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.78 
 
 		 967 aa  70.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  37.71 
 
 		 951 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 897 aa  70.1  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 1015 aa  69.7  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 		 974 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  34.15 
 
 		 914 aa  68.6  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  29.04 
 
 		 1054 aa  65.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 973 aa  65.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  48.68 
 
 		 947 aa  65.1  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2885  LuxR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 545 aa  64.7  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488052  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  29.51 
 
 		 955 aa  64.7  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  26.67 
 
 		 1029 aa  63.9  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>