More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2958 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 964 aa  1888    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  37.41 
 
 		 1008 aa  488  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  40.18 
 
 		 928 aa  466  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  37.82 
 
 		 967 aa  459  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.98 
 
 		 981 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  36.34 
 
 		 941 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.45 
 
 		 996 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  36.37 
 
 		 919 aa  415  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  34.73 
 
 		 913 aa  386  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  32.88 
 
 		 1022 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  34.35 
 
 		 992 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  35.85 
 
 		 962 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.99 
 
 		 930 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  35.87 
 
 		 1034 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  34.87 
 
 		 965 aa  366  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.35 
 
 		 921 aa  357  5.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  33.61 
 
 		 1025 aa  355  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  33.4 
 
 		 1003 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33.76 
 
 		 990 aa  354  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  32.72 
 
 		 993 aa  347  7e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  33.03 
 
 		 982 aa  345  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.63 
 
 		 1020 aa  343  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  33.23 
 
 		 1088 aa  339  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 946 aa  337  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  35.86 
 
 		 956 aa  335  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  32.76 
 
 		 934 aa  335  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.16 
 
 		 921 aa  332  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.87 
 
 		 1017 aa  332  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  38.28 
 
 		 935 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  32.75 
 
 		 992 aa  329  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  33.14 
 
 		 907 aa  326  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  33.3 
 
 		 931 aa  326  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  34.49 
 
 		 1025 aa  318  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  32 
 
 		 1022 aa  315  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  34.11 
 
 		 1030 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 1048 aa  313  6.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  34.11 
 
 		 954 aa  313  9e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  33.98 
 
 		 940 aa  312  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  37.19 
 
 		 1014 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  31.83 
 
 		 970 aa  311  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  31.83 
 
 		 1030 aa  311  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 1071 aa  308  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.01 
 
 		 1108 aa  307  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.32 
 
 		 950 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  34.51 
 
 		 908 aa  306  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  31.74 
 
 		 1013 aa  300  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  36.56 
 
 		 983 aa  296  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  33.91 
 
 		 1027 aa  296  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  31.63 
 
 		 1003 aa  291  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  35.57 
 
 		 1010 aa  287  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  31.57 
 
 		 1054 aa  286  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  34.88 
 
 		 995 aa  282  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  32.36 
 
 		 990 aa  281  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 654 aa  281  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  36.24 
 
 		 1138 aa  280  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  35.14 
 
 		 963 aa  280  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  33.29 
 
 		 775 aa  275  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  29.46 
 
 		 1033 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5351  hypothetical protein  37.34 
 
 		 862 aa  266  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  32.43 
 
 		 937 aa  265  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.91 
 
 		 965 aa  263  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  34.37 
 
 		 621 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 		 850 aa  261  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  32.27 
 
 		 788 aa  259  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  31.1 
 
 		 928 aa  258  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  37.9 
 
 		 1001 aa  258  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  30.44 
 
 		 1021 aa  257  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  33.52 
 
 		 790 aa  257  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  35.13 
 
 		 792 aa  254  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  35.5 
 
 		 1033 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  33.72 
 
 		 993 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 1319 aa  250  7e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 782 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  33.28 
 
 		 783 aa  247  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 		 926 aa  246  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  29.59 
 
 		 971 aa  245  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  32.88 
 
 		 1024 aa  243  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 622 aa  242  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 453 aa  241  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  34.29 
 
 		 632 aa  241  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.26 
 
 		 989 aa  238  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  32.67 
 
 		 978 aa  234  8.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  32.63 
 
 		 981 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 814 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.45 
 
 		 496 aa  231  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 1346 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  33.39 
 
 		 1003 aa  224  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  31.24 
 
 		 915 aa  223  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 792 aa  220  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  34.79 
 
 		 952 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  31.84 
 
 		 994 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  33.68 
 
 		 612 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  32.83 
 
 		 1011 aa  215  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  32.04 
 
 		 666 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 621 aa  213  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.72 
 
 		 631 aa  213  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 		 755 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  32.52 
 
 		 915 aa  212  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  30.11 
 
 		 797 aa  211  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  30.94 
 
 		 806 aa  210  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>