105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2732 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  100 
 
 		 387 aa  719    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  97.67 
 
 		 387 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  88.57 
 
 		 387 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  59.2 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  58.91 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  62.84 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  64.87 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  59.83 
 
 		 387 aa  335  9e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  60.06 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  49.19 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  43.97 
 
 		 411 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  39.38 
 
 		 402 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 397 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  41.8 
 
 		 410 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 402 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  42.77 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  43.36 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  39.58 
 
 		 410 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  41.95 
 
 		 400 aa  179  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  41.38 
 
 		 397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  37.8 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 399 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 425 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 416 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  36.49 
 
 		 416 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 400 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  35.36 
 
 		 414 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  33.15 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  32.39 
 
 		 402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 432 aa  133  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  34.55 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  32.39 
 
 		 402 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 405 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 		 404 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 403 aa  116  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  32.79 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  33.2 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  33.23 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 409 aa  92.8  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  30.86 
 
 		 216 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  25 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  29.61 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  26.52 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  30.98 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 436 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  28.18 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3320  hypothetical protein  44.44 
 
 		 151 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117954  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 452 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  28.64 
 
 		 452 aa  47  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.92 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 411 aa  46.2  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 411 aa  46.2  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.14 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2254  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.6 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  22.94 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  25.17 
 
 		 184 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  23.48 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3395  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  23.83 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>