More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4374 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  49.52 
 
 		 1150 aa  925    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  52.18 
 
 		 1152 aa  1031    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  51 
 
 		 1153 aa  1001    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  50.83 
 
 		 1153 aa  985    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  50.35 
 
 		 1153 aa  957    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  54.7 
 
 		 1151 aa  1036    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  56.35 
 
 		 1150 aa  1016    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  79.9 
 
 		 1154 aa  1708    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  77.83 
 
 		 1168 aa  1660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  45.34 
 
 		 1167 aa  745    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  77.04 
 
 		 1154 aa  1657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  80.5 
 
 		 1154 aa  1757    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  43.58 
 
 		 1151 aa  778    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1154 aa  2266    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  50.96 
 
 		 1153 aa  988    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  81.54 
 
 		 1154 aa  1768    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  78.25 
 
 		 1170 aa  1651    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  43.72 
 
 		 1151 aa  791    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  51.61 
 
 		 1153 aa  1025    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  52.35 
 
 		 1152 aa  955    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  52.26 
 
 		 1152 aa  1035    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  42.69 
 
 		 1148 aa  702    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  50.96 
 
 		 1152 aa  1003    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  45.19 
 
 		 1150 aa  723    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  46.3 
 
 		 1140 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.26 
 
 		 1173 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  30.47 
 
 		 1142 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  30.53 
 
 		 1142 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  30.27 
 
 		 1142 aa  395  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  31.16 
 
 		 1182 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  30.9 
 
 		 1175 aa  382  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  29.65 
 
 		 1190 aa  382  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  31.24 
 
 		 1164 aa  382  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 		 1145 aa  373  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1164 aa  369  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  31.44 
 
 		 1198 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  31.37 
 
 		 1198 aa  369  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  29.55 
 
 		 1173 aa  369  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  30 
 
 		 1139 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.01 
 
 		 1169 aa  366  1e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  30.93 
 
 		 1171 aa  363  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  30.81 
 
 		 1171 aa  362  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  61.68 
 
 		 1148 aa  362  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  31.88 
 
 		 1170 aa  360  6e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 		 1187 aa  360  9e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  31.13 
 
 		 1167 aa  360  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  29.21 
 
 		 1189 aa  357  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  53.65 
 
 		 1153 aa  352  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.61 
 
 		 1185 aa  351  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.43 
 
 		 1190 aa  348  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  27.72 
 
 		 1185 aa  347  8.999999999999999e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  42.32 
 
 		 1147 aa  345  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  30.28 
 
 		 1167 aa  343  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  52.01 
 
 		 1151 aa  342  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  51.84 
 
 		 1170 aa  341  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  51.44 
 
 		 1170 aa  338  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  25.84 
 
 		 1185 aa  338  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  30.32 
 
 		 1187 aa  337  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.48 
 
 		 1179 aa  332  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.62 
 
 		 1177 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  53.54 
 
 		 1167 aa  327  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  66.53 
 
 		 1144 aa  323  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  55.76 
 
 		 1147 aa  300  9e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.93 
 
 		 1179 aa  300  1e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  43.4 
 
 		 1511 aa  298  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.26 
 
 		 1181 aa  282  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.16 
 
 		 1403 aa  276  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  55.9 
 
 		 1165 aa  271  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.47 
 
 		 1164 aa  268  4e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  22.29 
 
 		 1180 aa  262  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  37.47 
 
 		 1176 aa  226  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  35.47 
 
 		 1175 aa  221  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  52.58 
 
 		 1195 aa  221  8.999999999999998e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  47.73 
 
 		 1171 aa  211  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  38.44 
 
 		 1164 aa  210  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.23 
 
 		 1177 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  48.86 
 
 		 1140 aa  207  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  47 
 
 		 1234 aa  207  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  47.93 
 
 		 814 aa  207  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  50.46 
 
 		 1185 aa  206  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  45.41 
 
 		 1170 aa  206  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  45.41 
 
 		 1170 aa  206  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  45.18 
 
 		 1170 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  30.97 
 
 		 1190 aa  203  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  49.03 
 
 		 1187 aa  201  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  40.41 
 
 		 1175 aa  201  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  29.36 
 
 		 1190 aa  201  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  33.8 
 
 		 1301 aa  200  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  34.6 
 
 		 1189 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  41.63 
 
 		 1174 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  42.39 
 
 		 1175 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  41.63 
 
 		 1174 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  42.8 
 
 		 1171 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  43.62 
 
 		 1172 aa  199  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  43.05 
 
 		 1174 aa  199  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  27.35 
 
 		 1185 aa  198  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  45 
 
 		 1165 aa  198  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  33.05 
 
 		 1177 aa  197  7e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  44.84 
 
 		 1148 aa  197  8.000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  44.95 
 
 		 1179 aa  197  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>