126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0343 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  761    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  56.89 
 
 		 331 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  55.88 
 
 		 380 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  48.65 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  55.29 
 
 		 359 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  50.57 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  52.66 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  46.96 
 
 		 352 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  49.45 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  46.31 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  48.63 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  35.19 
 
 		 982 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  34.52 
 
 		 1682 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  46.71 
 
 		 1562 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  47.95 
 
 		 1578 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  42.42 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  82.35 
 
 		 265 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  47.22 
 
 		 313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  37.61 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  40.23 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  44.06 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  40.22 
 
 		 1632 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  37.65 
 
 		 1698 aa  123  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  59.78 
 
 		 264 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  49.59 
 
 		 243 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  41.26 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  50.49 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  46.96 
 
 		 378 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  43.24 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  62.5 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  55.06 
 
 		 262 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  39.86 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  39.86 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  35.96 
 
 		 1669 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  59.26 
 
 		 218 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  46.22 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  48.15 
 
 		 265 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  51.69 
 
 		 249 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  67.21 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  45.53 
 
 		 275 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  45.05 
 
 		 240 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  53.41 
 
 		 265 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  37.43 
 
 		 1689 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  67.74 
 
 		 246 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  58.02 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  59.49 
 
 		 237 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  56.47 
 
 		 122 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  44.25 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  39.46 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  52.58 
 
 		 257 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  54.93 
 
 		 263 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  36.31 
 
 		 1723 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  33.19 
 
 		 1559 aa  93.2  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  66.67 
 
 		 263 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  43.27 
 
 		 1658 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  48.45 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  52.22 
 
 		 207 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  27.93 
 
 		 1623 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  28.87 
 
 		 690 aa  56.2  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  28.64 
 
 		 927 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  46.77 
 
 		 1917 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  29.67 
 
 		 3273 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  45.16 
 
 		 1942 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  30 
 
 		 554 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1840 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  28.21 
 
 		 738 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  31.79 
 
 		 1147 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  43.55 
 
 		 1763 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  41.94 
 
 		 2277 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  34.78 
 
 		 956 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1806 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 2031 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  38.78 
 
 		 2350 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 2032 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1825 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1825 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  33.62 
 
 		 1959 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  30.77 
 
 		 2031 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 2031 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  30.77 
 
 		 2554 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  31.55 
 
 		 2658 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  34.48 
 
 		 628 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  39.51 
 
 		 1791 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  29.87 
 
 		 1834 aa  47  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  27.5 
 
 		 2585 aa  46.6  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  27.55 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  37.78 
 
 		 2349 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  35.48 
 
 		 474 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  27.66 
 
 		 1681 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  34.88 
 
 		 1352 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  43.02 
 
 		 1611 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  36.17 
 
 		 1381 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  43.55 
 
 		 2961 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  38.04 
 
 		 1338 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  35.63 
 
 		 1710 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  30.53 
 
 		 1046 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  28.49 
 
 		 931 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1517 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  43.55 
 
 		 1577 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  29.75 
 
 		 1935 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>