208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3746 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  100 
 
 		 3542 aa  6932    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  39.72 
 
 		 4429 aa  513  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  37.63 
 
 		 3737 aa  416  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  44.31 
 
 		 2972 aa  219  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  44.75 
 
 		 652 aa  210  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  38.04 
 
 		 2980 aa  199  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  39.08 
 
 		 1672 aa  189  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  30.76 
 
 		 3793 aa  171  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  32.54 
 
 		 2402 aa  161  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  31.83 
 
 		 1232 aa  140  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  27.76 
 
 		 2270 aa  139  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  39.43 
 
 		 1879 aa  135  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  30.26 
 
 		 646 aa  134  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  33.61 
 
 		 707 aa  132  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  30.44 
 
 		 2005 aa  132  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  36.81 
 
 		 1222 aa  130  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  28.77 
 
 		 3563 aa  123  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  29.31 
 
 		 3544 aa  119  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  32.25 
 
 		 4231 aa  119  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.85 
 
 		 1673 aa  119  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  25.24 
 
 		 2278 aa  116  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  32.57 
 
 		 1544 aa  108  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  33.46 
 
 		 4465 aa  107  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  33.11 
 
 		 3911 aa  104  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1386 aa  100  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  46.51 
 
 		 1230 aa  100  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.72 
 
 		 11716 aa  99.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  43.33 
 
 		 890 aa  95.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  27.53 
 
 		 3699 aa  95.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  36.15 
 
 		 1602 aa  94.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  33.08 
 
 		 1620 aa  91.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  35.39 
 
 		 726 aa  90.5  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  31.95 
 
 		 683 aa  90.1  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.43 
 
 		 887 aa  90.1  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  27.14 
 
 		 2807 aa  87.8  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  29.16 
 
 		 2522 aa  87.4  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  29.4 
 
 		 2820 aa  87.4  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  24.7 
 
 		 4071 aa  85.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  28.63 
 
 		 2853 aa  85.9  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  26.99 
 
 		 1657 aa  85.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  25.39 
 
 		 2411 aa  84.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  40.45 
 
 		 1222 aa  84.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1329 aa  84.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  28.81 
 
 		 885 aa  84  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.31 
 
 		 1606 aa  83.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  25.39 
 
 		 2367 aa  82  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.48 
 
 		 3699 aa  82.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  40.45 
 
 		 496 aa  81.6  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  38.04 
 
 		 650 aa  80.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  41.38 
 
 		 1466 aa  80.9  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  26.72 
 
 		 794 aa  80.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  28.69 
 
 		 1976 aa  80.5  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  40.91 
 
 		 694 aa  80.1  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  23.02 
 
 		 792 aa  78.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  25.24 
 
 		 886 aa  79  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  38.2 
 
 		 662 aa  78.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  30.85 
 
 		 2001 aa  79  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  39.77 
 
 		 429 aa  78.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2281  serine threonine rich antigen  42.55 
 
 		 1870 aa  77.8  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2678  cell wall anchor domain-containing protein  40 
 
 		 2271 aa  77.4  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2734  cell wall anchor domain-containing protein  40 
 
 		 2271 aa  77.4  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1303 aa  77.4  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  32.77 
 
 		 1140 aa  77.4  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  40.4 
 
 		 749 aa  77  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  40.85 
 
 		 1245 aa  76.6  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  23.94 
 
 		 938 aa  76.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  33.6 
 
 		 598 aa  75.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  30.19 
 
 		 3598 aa  75.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.12 
 
 		 692 aa  75.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  27.5 
 
 		 2636 aa  74.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  26 
 
 		 2421 aa  74.7  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  29.57 
 
 		 658 aa  74.7  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  26 
 
 		 2454 aa  74.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  40.91 
 
 		 2833 aa  73.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  30.46 
 
 		 991 aa  72.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  29.32 
 
 		 1108 aa  72.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  38.04 
 
 		 642 aa  72.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  40.91 
 
 		 532 aa  72.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  22.92 
 
 		 627 aa  72  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  28.45 
 
 		 2079 aa  72  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1313 aa  72.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1488 aa  72.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  35.87 
 
 		 496 aa  72  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1980 aa  71.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  30.17 
 
 		 540 aa  71.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1287 aa  70.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  32.38 
 
 		 1987 aa  71.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  32.95 
 
 		 636 aa  70.5  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1059 aa  70.5  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  44.44 
 
 		 677 aa  70.5  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  30.71 
 
 		 503 aa  69.7  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.09 
 
 		 1272 aa  69.7  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  40.66 
 
 		 2377 aa  69.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  24.73 
 
 		 822 aa  68.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  37.08 
 
 		 561 aa  68.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  24.55 
 
 		 2713 aa  68.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  26.27 
 
 		 637 aa  68.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  31.77 
 
 		 3244 aa  68.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  32.06 
 
 		 1748 aa  68.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  35.16 
 
 		 2375 aa  68.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>