28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2281 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2281  serine threonine rich antigen  100 
 
 		 1870 aa  3432    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2678  cell wall anchor domain-containing protein  54 
 
 		 2271 aa  784    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2734  cell wall anchor domain-containing protein  54 
 
 		 2271 aa  784    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  52.07 
 
 		 2402 aa  159  7e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  18.57 
 
 		 1034 aa  105  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  44.2 
 
 		 3542 aa  90.1  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.79 
 
 		 2325 aa  83.2  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0456  hypothetical protein  34.86 
 
 		 2764 aa  66.6  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000000873422 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2489  hypothetical protein  45.9 
 
 		 172 aa  64.7  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  41.77 
 
 		 1148 aa  61.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  30 
 
 		 2506 aa  61.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  34.78 
 
 		 1779 aa  58.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  33.78 
 
 		 1081 aa  57  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  35.62 
 
 		 3598 aa  56.6  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  34.58 
 
 		 494 aa  54.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  34.43 
 
 		 2079 aa  54.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  34.62 
 
 		 3244 aa  53.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  38.55 
 
 		 3222 aa  52.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  35.1 
 
 		 4465 aa  52.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  37.41 
 
 		 672 aa  52  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  33.12 
 
 		 1232 aa  51.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  32.05 
 
 		 3563 aa  50.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  32.87 
 
 		 4231 aa  49.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  44.93 
 
 		 3230 aa  49.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  29.07 
 
 		 1672 aa  48.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  31.18 
 
 		 2853 aa  48.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  32.17 
 
 		 3544 aa  47.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  32.98 
 
 		 2820 aa  48.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>