158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4475 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  406  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  33.16 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  38.46 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  31.93 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2653  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0164897  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.43 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  27.12 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 263 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 247 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  41.86 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  40.98 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  36 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  37.04 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>