222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03673 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  70.25 
 
 		 780 aa  1121    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  45.16 
 
 		 796 aa  644    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 768 aa  1561    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  27.19 
 
 		 768 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 768 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 747 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 765 aa  218  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 772 aa  210  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 738 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 738 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 777 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 792 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 753 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 777 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 766 aa  171  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  26.03 
 
 		 760 aa  162  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  26.17 
 
 		 760 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 815 aa  157  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 747 aa  152  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 746 aa  150  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 791 aa  144  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 781 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 814 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 799 aa  135  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 786 aa  130  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 736 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 729 aa  121  4.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 762 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 782 aa  112  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 808 aa  101  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 790 aa  99.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 798 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.31 
 
 		 766 aa  82  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 835 aa  81.3  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 828 aa  80.5  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2998  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 799 aa  79  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2608  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 824 aa  78.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 833 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 841 aa  74.3  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 781 aa  73.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 772 aa  68.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 742 aa  68.2  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.27 
 
 		 706 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  27.73 
 
 		 693 aa  63.9  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  25 
 
 		 730 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 765 aa  62  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 768 aa  62  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 798 aa  62  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 768 aa  62  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 714 aa  61.6  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 724 aa  61.6  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  24.79 
 
 		 803 aa  61.2  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 786 aa  61.2  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 807 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 751 aa  60.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  23.55 
 
 		 647 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 792 aa  59.7  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  23.77 
 
 		 740 aa  58.9  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 790 aa  58.9  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 		 710 aa  58.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 721 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 760 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 721 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 712 aa  57  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 815 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 705 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 825 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  20.9 
 
 		 735 aa  56.6  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 763 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28.83 
 
 		 755 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 825 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 707 aa  56.6  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  20.9 
 
 		 735 aa  56.6  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  28.65 
 
 		 698 aa  56.2  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 705 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.56 
 
 		 696 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 828 aa  55.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.56 
 
 		 696 aa  55.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 764 aa  55.5  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 795 aa  55.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  21.68 
 
 		 703 aa  55.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  29.08 
 
 		 398 aa  55.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  27.2 
 
 		 697 aa  55.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  29.08 
 
 		 398 aa  55.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 712 aa  55.1  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 773 aa  55.1  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 712 aa  54.7  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  25.32 
 
 		 734 aa  54.7  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  23.76 
 
 		 740 aa  53.9  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 751 aa  53.9  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 651 aa  53.5  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 733 aa  54.3  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 780 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 756 aa  53.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  24.43 
 
 		 768 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 722 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 706 aa  52.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  24.12 
 
 		 741 aa  52.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.22 
 
 		 663 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>