114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03563 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  100 
 
 		 392 aa  811    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  31.84 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  33.44 
 
 		 349 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  51.14 
 
 		 131 aa  90.9  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  47.73 
 
 		 206 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  47.67 
 
 		 206 aa  89.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  47.73 
 
 		 206 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  47.73 
 
 		 206 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  47.73 
 
 		 206 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  46.51 
 
 		 204 aa  87  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  47.73 
 
 		 207 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  47.73 
 
 		 207 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  47.73 
 
 		 207 aa  87  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  47.73 
 
 		 206 aa  87  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  46.59 
 
 		 207 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  46.51 
 
 		 207 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  46.59 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  37.17 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  46.59 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  45.45 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  45.35 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  46.51 
 
 		 206 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  45.45 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  39.22 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  34.51 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  32.48 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  41.18 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  40.91 
 
 		 203 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  44.19 
 
 		 219 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  43.18 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  41.67 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  38.1 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  40.7 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  40.7 
 
 		 203 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  40.7 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  40.7 
 
 		 203 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  40.7 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  33.33 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  40.7 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  36.73 
 
 		 203 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  35.71 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  41.86 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  34.52 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  34.52 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  35.37 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  38.1 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  36.05 
 
 		 202 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  34.17 
 
 		 582 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  34.15 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  34.15 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  37.68 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  34.15 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  40 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  42.47 
 
 		 252 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  36.05 
 
 		 203 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  30.59 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  26.71 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  29.03 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  31.4 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  42.86 
 
 		 115 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  35.44 
 
 		 206 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  39.68 
 
 		 270 aa  54.7  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  34.12 
 
 		 244 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  35.56 
 
 		 205 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  33.33 
 
 		 202 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  38.32 
 
 		 859 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  38.1 
 
 		 700 aa  53.1  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  34.12 
 
 		 245 aa  53.1  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  33.33 
 
 		 199 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  31.4 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  33.72 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  32.94 
 
 		 255 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  36.14 
 
 		 215 aa  50.4  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  34.67 
 
 		 565 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2087  TonB family protein  30.23 
 
 		 219 aa  50.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.000490312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  42.42 
 
 		 234 aa  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  40.28 
 
 		 462 aa  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4060  TonB family protein  38.24 
 
 		 263 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.910663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  32.14 
 
 		 397 aa  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4100  TonB family protein  36.36 
 
 		 234 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.694264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  29.07 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  37.35 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  30.95 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  39.68 
 
 		 260 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05000  TonB protein  39.13 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00767831  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  39.39 
 
 		 218 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  31.76 
 
 		 112 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  28.38 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  34.25 
 
 		 228 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  34.92 
 
 		 221 aa  46.6  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  34.92 
 
 		 221 aa  46.2  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  36.23 
 
 		 223 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  33.78 
 
 		 209 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  37.65 
 
 		 267 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  32.14 
 
 		 134 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  37.68 
 
 		 121 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1010  TonB family protein  33.33 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128587 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  35.29 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  31.5 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>