160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1395 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  100 
 
 		 1100 aa  2198    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  71.46 
 
 		 1000 aa  1268    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  46.07 
 
 		 806 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  46.07 
 
 		 806 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  46.07 
 
 		 806 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  46.07 
 
 		 806 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  46.07 
 
 		 806 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  46.07 
 
 		 806 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  46.07 
 
 		 806 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  42.9 
 
 		 805 aa  479  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  42.9 
 
 		 858 aa  479  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  42.9 
 
 		 800 aa  479  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  42.74 
 
 		 858 aa  479  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  42.74 
 
 		 858 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  42.9 
 
 		 800 aa  479  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  42.7 
 
 		 807 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  45.74 
 
 		 806 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  49.79 
 
 		 638 aa  442  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  44.26 
 
 		 1222 aa  396  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  43.63 
 
 		 1567 aa  379  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  35.1 
 
 		 593 aa  225  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  30.37 
 
 		 918 aa  206  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  30.15 
 
 		 797 aa  163  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  31.12 
 
 		 781 aa  151  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  30.43 
 
 		 781 aa  152  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  27.47 
 
 		 947 aa  135  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  27.47 
 
 		 909 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  27.09 
 
 		 517 aa  123  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  30.47 
 
 		 831 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  28.38 
 
 		 759 aa  115  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  26.27 
 
 		 671 aa  87.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  23.38 
 
 		 652 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  23.38 
 
 		 652 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  26.75 
 
 		 757 aa  82.4  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4195  hypothetical protein  26.52 
 
 		 650 aa  80.1  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  38.26 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  36 
 
 		 436 aa  73.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  35.66 
 
 		 794 aa  70.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  31.87 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  26.17 
 
 		 1016 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  30.67 
 
 		 576 aa  64.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  35.81 
 
 		 487 aa  63.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  26.63 
 
 		 789 aa  62.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  32.26 
 
 		 634 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  29.8 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  32.56 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  30.57 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.87 
 
 		 1072 aa  62  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 1577 aa  61.6  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  35.77 
 
 		 368 aa  60.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  36.75 
 
 		 574 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.07 
 
 		 476 aa  60.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.11 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 672 aa  59.7  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  32.81 
 
 		 803 aa  59.7  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  31.21 
 
 		 691 aa  59.3  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  29.32 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  29.82 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  29.31 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  34.38 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  31.78 
 
 		 560 aa  58.9  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  28.99 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  29.93 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  31.82 
 
 		 380 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  29.14 
 
 		 516 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  30.3 
 
 		 451 aa  57.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  31.58 
 
 		 566 aa  56.6  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  27.82 
 
 		 493 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.46 
 
 		 500 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  38.78 
 
 		 430 aa  55.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.53 
 
 		 489 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  34.56 
 
 		 373 aa  55.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.67 
 
 		 474 aa  55.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  30.15 
 
 		 884 aa  55.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  31.45 
 
 		 426 aa  55.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  29.46 
 
 		 726 aa  55.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  31.65 
 
 		 748 aa  55.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  32.26 
 
 		 414 aa  54.7  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  30.77 
 
 		 801 aa  54.7  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02420  glyoxal oxidase precursor, putative  24.9 
 
 		 631 aa  54.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  31.06 
 
 		 494 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  30.88 
 
 		 957 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  34.44 
 
 		 618 aa  54.3  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4814  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  28.68 
 
 		 183 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  28.65 
 
 		 563 aa  53.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  25.36 
 
 		 366 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  34.21 
 
 		 493 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  31.06 
 
 		 732 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  26.98 
 
 		 498 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  28.26 
 
 		 644 aa  52.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  28.67 
 
 		 1139 aa  53.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 568 aa  52.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  32.85 
 
 		 412 aa  53.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  28 
 
 		 507 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  28.79 
 
 		 589 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.86 
 
 		 627 aa  52.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  33.77 
 
 		 479 aa  52.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  27.15 
 
 		 586 aa  52.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  30.67 
 
 		 576 aa  52.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  30.86 
 
 		 647 aa  52.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>