40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4814 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4814  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  100 
 
 		 183 aa  371  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  37.35 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  29.01 
 
 		 1100 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  32.86 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  29.55 
 
 		 446 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6476  Ricin B lectin  33.07 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  26.52 
 
 		 497 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  30.66 
 
 		 380 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.68 
 
 		 493 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 709 aa  47.8  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  30.37 
 
 		 461 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  34.09 
 
 		 391 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  30.53 
 
 		 603 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.03 
 
 		 1072 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  30.91 
 
 		 479 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  30.56 
 
 		 803 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  28.89 
 
 		 498 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  28.18 
 
 		 890 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  27.78 
 
 		 492 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  28.97 
 
 		 374 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.19 
 
 		 489 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  30.56 
 
 		 490 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  30.28 
 
 		 373 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  33.64 
 
 		 653 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.89 
 
 		 507 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  23.73 
 
 		 426 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  28.99 
 
 		 547 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  33.61 
 
 		 1128 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.77 
 
 		 695 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  34.38 
 
 		 468 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  29.63 
 
 		 472 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  30.08 
 
 		 847 aa  42  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  28.7 
 
 		 1000 aa  42  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  32.94 
 
 		 516 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  29.76 
 
 		 589 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  26.15 
 
 		 436 aa  41.6  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  31.33 
 
 		 423 aa  41.6  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  29.63 
 
 		 801 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.3 
 
 		 933 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  30.91 
 
 		 801 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>