97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0510 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 798 aa  1628    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 815 aa  239  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  27.23 
 
 		 760 aa  224  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 747 aa  217  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  26.86 
 
 		 760 aa  217  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 746 aa  196  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 786 aa  196  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 782 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 729 aa  152  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 841 aa  146  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 828 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 747 aa  142  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 738 aa  142  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 738 aa  142  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.66 
 
 		 766 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 772 aa  134  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 777 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 753 aa  130  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  24.37 
 
 		 768 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 736 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 792 aa  121  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 768 aa  119  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 796 aa  117  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 777 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 765 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 780 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 799 aa  105  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 766 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  22.05 
 
 		 781 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 768 aa  97.8  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 786 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 790 aa  87.4  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  22.95 
 
 		 740 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 791 aa  75.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  19 
 
 		 765 aa  73.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 835 aa  72.8  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 762 aa  72  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  28.65 
 
 		 734 aa  67.8  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  26.42 
 
 		 740 aa  65.1  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 792 aa  63.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 756 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 782 aa  62.4  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  24.39 
 
 		 651 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 790 aa  58.5  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 781 aa  57.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  22.94 
 
 		 741 aa  57  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 808 aa  57.4  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  27.35 
 
 		 398 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  27.35 
 
 		 398 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  21.95 
 
 		 814 aa  55.5  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 742 aa  55.5  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 754 aa  54.7  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 754 aa  54.7  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  25.11 
 
 		 693 aa  54.3  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  25.4 
 
 		 730 aa  52.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  22.4 
 
 		 726 aa  51.2  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 796 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  22.16 
 
 		 704 aa  50.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  24.35 
 
 		 794 aa  49.7  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 796 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  22.58 
 
 		 710 aa  48.5  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 758 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 736 aa  48.5  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 796 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  21.3 
 
 		 772 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 793 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 		 716 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 697 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 709 aa  47  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  23.57 
 
 		 803 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  22.96 
 
 		 742 aa  47  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 833 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.87 
 
 		 701 aa  45.8  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0138  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.41 
 
 		 810 aa  45.8  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0694219  normal  0.222818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 809 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  20.21 
 
 		 711 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 796 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.26 
 
 		 766 aa  45.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.73 
 
 		 689 aa  45.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 680 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 758 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  23.99 
 
 		 650 aa  45.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1311  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 720 aa  45.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 854 aa  45.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 675 aa  44.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3467  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 285 aa  45.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 681 aa  44.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  23.19 
 
 		 755 aa  44.7  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 628 aa  44.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  20.81 
 
 		 731 aa  44.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2147  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 760 aa  44.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 750 aa  44.3  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 768 aa  44.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 726 aa  44.3  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 768 aa  44.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  24.43 
 
 		 688 aa  44.3  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  23.44 
 
 		 882 aa  44.3  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>