100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3680 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  63.69 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  62.42 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 188 aa  91.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  36.29 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  43 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 167 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  40.82 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  38.15 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  41.51 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  22.28 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  42.27 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  38.24 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  33.09 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  36.08 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4166  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  39.29 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 268 aa  44.7  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3420  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  30.19 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  36.67 
 
 		 227 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  24.17 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  24.47 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 191 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 199 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 180 aa  42  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 216 aa  42  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  42  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5421  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 182 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 219 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0234  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 175 aa  42  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 219 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 325 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 217 aa  41.2  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 247 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 270 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>