More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0652 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0652  diguanylate cyclase  100 
 
 		 566 aa  1080    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.660583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4063  diguanylate cyclase  48.44 
 
 		 594 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0595  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.93 
 
 		 752 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1544  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.29 
 
 		 762 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3541  diguanylate cyclase  36.73 
 
 		 501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3507  diguanylate cyclase  36.72 
 
 		 487 aa  168  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1663  diguanylate cyclase  34.48 
 
 		 491 aa  154  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4161  diguanylate cyclase  33.58 
 
 		 490 aa  130  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0680  diguanylate cyclase  46.15 
 
 		 466 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1491  diguanylate cyclase  33.96 
 
 		 562 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3476  diguanylate cyclase  32.43 
 
 		 298 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0241  diguanylate cyclase  40.16 
 
 		 640 aa  111  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3704  diguanylate cyclase  45.3 
 
 		 460 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  33.33 
 
 		 1079 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1107  two component signal transduction response regulator  34.39 
 
 		 323 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0655  diguanylate cyclase  31.67 
 
 		 172 aa  109  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000725118  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  32.58 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  34.17 
 
 		 565 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1536  diguanylate cyclase  32.58 
 
 		 278 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370191  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  43.92 
 
 		 466 aa  108  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2194  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.64 
 
 		 636 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1598  diguanylate cyclase  39.26 
 
 		 257 aa  107  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  31.08 
 
 		 663 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2276  diguanylate cyclase  39.26 
 
 		 257 aa  107  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40422  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  33.92 
 
 		 377 aa  106  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  36.32 
 
 		 454 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  36.28 
 
 		 457 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3138  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.67 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  47.58 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1846  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.55 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1136  diguanylate cyclase  32.27 
 
 		 582 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1355  diguanylate cyclase  33.48 
 
 		 487 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133394  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2523  diguanylate cyclase  34.5 
 
 		 587 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1440  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.96 
 
 		 315 aa  104  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0301186  normal  0.059237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  32.89 
 
 		 457 aa  103  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  41.67 
 
 		 949 aa  103  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0095  putative sensory transduction system, regulatory protein  36.65 
 
 		 536 aa  103  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.348008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0336  diguanylate cyclase  32.66 
 
 		 519 aa  103  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0386848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  34.22 
 
 		 457 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1808  diguanylate cyclase  33.15 
 
 		 247 aa  103  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2693  diguanylate cyclase  34.86 
 
 		 570 aa  103  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  42.77 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0204  diguanylate cyclase  33.93 
 
 		 453 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.209858  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2092  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 459 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000936351  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2668  diguanylate cyclase  43.31 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1161  diguanylate cyclase  31.58 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0876222  normal  0.647833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2218  GGDEF  34.21 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1063  diguanylate cyclase  49.09 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2380  diguanylate cyclase  31.62 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2227  diguanylate cyclase  34.1 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2263  hypothetical protein  39.49 
 
 		 260 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0552283  normal  0.0379281 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  32.88 
 
 		 291 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1972  diguanylate cyclase  28.93 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.719154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2104  diguanylate cyclase  35.02 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28880  diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein  33.47 
 
 		 409 aa  102  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1872  diguanylate cyclase  34.1 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2337  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.01 
 
 		 461 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3473  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.03 
 
 		 351 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.84 
 
 		 668 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.88 
 
 		 710 aa  101  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4960  GGDEF  30.58 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.806512  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0621  diguanylate cyclase  39.66 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.36 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  32.89 
 
 		 462 aa  100  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3728  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 341 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.183496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3024  diguanylate cyclase  42.06 
 
 		 260 aa  100  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  0.207783 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3654  diguanylate cyclase  31.56 
 
 		 473 aa  100  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4329  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 320 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.406414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3480  diguanylate cyclase  33.72 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232889  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2370  diguanylate cyclase  34.56 
 
 		 342 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257282  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.73 
 
 		 668 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3137  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 319 aa  100  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2092  diguanylate cyclase  34.56 
 
 		 342 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0157551  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03790  sensory box GGDEF domain-containing protein  49.09 
 
 		 323 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.228486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.25 
 
 		 322 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2950  diguanylate cyclase  35.52 
 
 		 485 aa  100  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805106  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0043  diguanylate cyclase  36.07 
 
 		 580 aa  100  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1616  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.34 
 
 		 796 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405684 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  42.31 
 
 		 498 aa  100  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0840  diguanylate cyclase  33.63 
 
 		 411 aa  100  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4122  diguanylate cyclase  33.72 
 
 		 395 aa  100  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.519011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.25 
 
 		 322 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0381  hypothetical protein  49.09 
 
 		 323 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3052  GGDEF  32.13 
 
 		 523 aa  99.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.927179  normal  0.0159246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0719  diguanylate cyclase  42.98 
 
 		 370 aa  99.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0936  GGDEF domain-containing protein  42.76 
 
 		 301 aa  100  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0985  diguanylate cyclase  43.14 
 
 		 508 aa  99.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  35 
 
 		 360 aa  99.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  33.19 
 
 		 354 aa  99.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2553  diguanylate cyclase  43.75 
 
 		 484 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.928097  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3459  diguanylate cyclase  43.86 
 
 		 324 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  46.46 
 
 		 457 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1148  diguanylate cyclase  27.13 
 
 		 634 aa  100  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0203006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3308  diguanylate cyclase  30.36 
 
 		 603 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000660005  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2049  GGDEF family protein  34.1 
 
 		 319 aa  99.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2096  diguanylate cyclase  35.02 
 
 		 368 aa  99  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1834  diguanylate cyclase  39.85 
 
 		 525 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.245567  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2253  diguanylate cyclase  34.56 
 
 		 342 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0242555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.86 
 
 		 586 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0571  diguanylate cyclase  43.86 
 
 		 324 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>