198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1476 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  100 
 
 		 841 aa  1714    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  59.52 
 
 		 828 aa  1038    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  32.92 
 
 		 838 aa  437  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  28.85 
 
 		 855 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  28.17 
 
 		 848 aa  356  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  28.29 
 
 		 853 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  28 
 
 		 853 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  26.7 
 
 		 856 aa  324  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  29.05 
 
 		 839 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  28.14 
 
 		 857 aa  293  8e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  26.72 
 
 		 843 aa  290  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  24.38 
 
 		 877 aa  222  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  24.53 
 
 		 831 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  23.79 
 
 		 816 aa  121  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  22.54 
 
 		 814 aa  120  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  22.57 
 
 		 828 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1719  hypothetical protein  21.52 
 
 		 811 aa  98.2  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0193339  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  21.85 
 
 		 829 aa  98.2  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  21.87 
 
 		 849 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  37.04 
 
 		 1053 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 984 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 887 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1023 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 929 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  34.94 
 
 		 1119 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 922 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1102 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  37.65 
 
 		 1063 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 1109 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  21.95 
 
 		 925 aa  56.6  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1020 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  33.66 
 
 		 1237 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1008 aa  55.8  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  37.11 
 
 		 977 aa  55.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1082 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  35.64 
 
 		 1152 aa  55.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1127 aa  55.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  31.53 
 
 		 1047 aa  54.7  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1016 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 1003 aa  54.7  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1011 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 1083 aa  54.7  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 1059 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 1081 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 992 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 873 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  36.21 
 
 		 1030 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.7 
 
 		 1023 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1058 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 1045 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 		 1116 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1019 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1034 aa  53.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 1078 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1173 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1103 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1077 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 975 aa  52.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1059 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  32.67 
 
 		 1010 aa  52.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  36.21 
 
 		 927 aa  52  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  34.86 
 
 		 1040 aa  52  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 1008 aa  52  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1131  hypothetical protein  33.77 
 
 		 236 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.543698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1079 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 955 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  29.37 
 
 		 1129 aa  51.2  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1070 aa  50.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3079  hypothetical protein  27.78 
 
 		 930 aa  51.2  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0337116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  30.91 
 
 		 942 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 1093 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 1029 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1023 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1081 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1062 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1188 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1095 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  37.17 
 
 		 1049 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.45 
 
 		 1063 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 1168 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 999 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1050 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1103 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  35.05 
 
 		 1163 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1132 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  38.1 
 
 		 1089 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 874 aa  49.3  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1176 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  36.52 
 
 		 914 aa  49.3  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 1043 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 1033 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1146 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1202 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1096 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  33.01 
 
 		 1028 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1038 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 1114 aa  48.9  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1142 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1055 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1127 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>