More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3037 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3756  diguanylate cyclase  99.01 
 
 		 577 aa  1010    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3037  7TM domain sensor diguanylate cyclase  100 
 
 		 506 aa  1023    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4205  sensor diguanylate cyclase  39.31 
 
 		 642 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0651  diguanylate cyclase  31.09 
 
 		 627 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.605256  hitchhiker  0.0000117316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65090  hypothetical protein  32.03 
 
 		 673 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5656  GGDEF domain-containing protein  31.36 
 
 		 629 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  28.54 
 
 		 630 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0469  diguanylate cyclase  29.71 
 
 		 601 aa  171  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  30.07 
 
 		 614 aa  169  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  29.73 
 
 		 578 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  29.44 
 
 		 612 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  24.95 
 
 		 588 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00565  Signaling protein with a acyltransferase and GGDEF domains  25.05 
 
 		 628 aa  153  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1906  response regulator receiver domain-containing protein  27.63 
 
 		 603 aa  146  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  25.38 
 
 		 611 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1153  diguanylate cyclase  30.27 
 
 		 596 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.442479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  27.01 
 
 		 638 aa  141  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  26.52 
 
 		 636 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1073  7TM domain sensor diguanylate cyclase  30.16 
 
 		 596 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.494808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  28.68 
 
 		 565 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3471  diguanylate cyclase  29.1 
 
 		 618 aa  137  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2693  diguanylate cyclase  31.59 
 
 		 570 aa  133  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0397  diguanylate cyclase  45.22 
 
 		 555 aa  130  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0581  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.57 
 
 		 659 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05790  transmembrane signal transduction protein  28.89 
 
 		 634 aa  129  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1301  diguanylate cyclase  31.11 
 
 		 561 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3372  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.57 
 
 		 659 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1062  diguanylate cyclase  26.16 
 
 		 566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0191664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3606  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.83 
 
 		 757 aa  126  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  26.42 
 
 		 629 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37690  putative sensory box protein  46.41 
 
 		 864 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0535605 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1864  putative diguanylate cyclase  41.48 
 
 		 882 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  30 
 
 		 677 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.57 
 
 		 695 aa  124  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2709  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.75 
 
 		 873 aa  124  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.602276 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.21 
 
 		 1264 aa  124  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1578  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.72 
 
 		 631 aa  123  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2111  diguanylate cyclase  36.87 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.672445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  26.74 
 
 		 564 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.58 
 
 		 781 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.015368  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3543  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.16 
 
 		 659 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1509  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.52 
 
 		 571 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44121  normal  0.0349148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0796  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.42 
 
 		 765 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.341606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3052  GGDEF  43.21 
 
 		 523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.927179  normal  0.0159246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3255  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40 
 
 		 774 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449187  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1707  sensory box-containing diguanylate cyclase, putative  44.25 
 
 		 1057 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1779  diguanylate cyclase  39.22 
 
 		 215 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2678  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.23 
 
 		 515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3975  GGDEF  40.91 
 
 		 523 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.456822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.83 
 
 		 693 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1034  diguanylate cyclase  42.04 
 
 		 283 aa  121  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.22 
 
 		 722 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  30.12 
 
 		 668 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1641  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.02 
 
 		 755 aa  120  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.130236 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.95 
 
 		 664 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1891  GGDEF family protein  36.79 
 
 		 435 aa  119  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0989332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0760  diguanylate cyclase  41.38 
 
 		 495 aa  119  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.126237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0693  diguanylate cyclase  33.49 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3523  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.06 
 
 		 872 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.738639 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000161  GGDEF family protein  42.42 
 
 		 652 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3221  sensory box-containing diguanylate cyclase  45.75 
 
 		 858 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3581  GGDEF domain-containing protein  34.18 
 
 		 695 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1078  diguanylate cyclase  41.14 
 
 		 283 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.239628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2393  signal transduction protein  32.19 
 
 		 817 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.512634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3694  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.35 
 
 		 664 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0693  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.35 
 
 		 664 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.35 
 
 		 664 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.07 
 
 		 728 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0430  GGDEF domain-containing protein  42.21 
 
 		 532 aa  118  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2664  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.16 
 
 		 1063 aa  118  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0172  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.02 
 
 		 685 aa  118  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1154  sensory box protein  48.37 
 
 		 861 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369215  normal  0.176732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3309  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.02 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3055  sensory box-containing protein  39.31 
 
 		 847 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1089  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40 
 
 		 667 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.973751  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3192  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.76 
 
 		 736 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2703  diguanylate cyclase  34.73 
 
 		 339 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2333  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.46 
 
 		 695 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8066  hypothetical protein  36.72 
 
 		 314 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0556463  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0422  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.53 
 
 		 1492 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.144881  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2024  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.97 
 
 		 665 aa  117  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2249  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  39.79 
 
 		 908 aa  117  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1146  diguanylate cyclase  42.77 
 
 		 350 aa  117  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.923994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2092  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.02 
 
 		 545 aa  117  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.403433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.89 
 
 		 1505 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.40172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3182  GGDEF domain-containing protein  40.7 
 
 		 754 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2916  diguanylate cyclase  42.42 
 
 		 266 aa  117  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2190  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.46 
 
 		 695 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1188  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  48.37 
 
 		 861 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.179434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2237  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.56 
 
 		 556 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0221  GGDEF domain-containing protein  37.43 
 
 		 710 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2209  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.98 
 
 		 844 aa  117  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2798  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.46 
 
 		 695 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06699  hypothetical protein  41.03 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1920  diguanylate cyclase  30.6 
 
 		 346 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2940  sensor diguanylate cyclase  26.06 
 
 		 571 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.43 
 
 		 965 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.928447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1618  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.81 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.465864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2737  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40 
 
 		 951 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000925868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  38.33 
 
 		 1093 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>