More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3756 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3037  7TM domain sensor diguanylate cyclase  99.01 
 
 		 506 aa  1010    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3756  diguanylate cyclase  100 
 
 		 577 aa  1158    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4205  sensor diguanylate cyclase  38.93 
 
 		 642 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0651  diguanylate cyclase  30.72 
 
 		 627 aa  230  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.605256  hitchhiker  0.0000117316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65090  hypothetical protein  31.72 
 
 		 673 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5656  GGDEF domain-containing protein  31.26 
 
 		 629 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  28.17 
 
 		 630 aa  180  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0469  diguanylate cyclase  29.86 
 
 		 601 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  30.2 
 
 		 614 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  30.65 
 
 		 578 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  29.67 
 
 		 612 aa  161  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  24.73 
 
 		 588 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  25.22 
 
 		 611 aa  152  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00565  Signaling protein with a acyltransferase and GGDEF domains  25.05 
 
 		 628 aa  151  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1906  response regulator receiver domain-containing protein  27.95 
 
 		 603 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1153  diguanylate cyclase  30.47 
 
 		 596 aa  145  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.442479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1073  7TM domain sensor diguanylate cyclase  30.35 
 
 		 596 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.494808  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  26.66 
 
 		 636 aa  140  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  28.75 
 
 		 565 aa  140  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  27.01 
 
 		 638 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3471  diguanylate cyclase  28.86 
 
 		 618 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 668 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2693  diguanylate cyclase  31.82 
 
 		 570 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1062  diguanylate cyclase  24.91 
 
 		 566 aa  133  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0191664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  26.74 
 
 		 564 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  30.79 
 
 		 677 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05790  transmembrane signal transduction protein  29.27 
 
 		 634 aa  132  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1301  diguanylate cyclase  31.57 
 
 		 561 aa  130  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 782 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3606  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.4 
 
 		 757 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0581  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.57 
 
 		 659 aa  128  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0397  diguanylate cyclase  44.59 
 
 		 555 aa  127  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3372  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.57 
 
 		 659 aa  127  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2678  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.71 
 
 		 515 aa  127  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.83 
 
 		 1264 aa  127  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37690  putative sensory box protein  46.41 
 
 		 864 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0535605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2111  diguanylate cyclase  37.37 
 
 		 290 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.672445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3052  GGDEF  43.83 
 
 		 523 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.927179  normal  0.0159246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  26.73 
 
 		 629 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2709  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.75 
 
 		 873 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.602276 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.57 
 
 		 695 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3255  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.56 
 
 		 774 aa  124  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1864  putative diguanylate cyclase  41.48 
 
 		 882 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327534  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1641  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.51 
 
 		 755 aa  124  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.130236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1707  sensory box-containing diguanylate cyclase, putative  44.83 
 
 		 1057 aa  124  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  29.72 
 
 		 795 aa  124  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.58 
 
 		 781 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.015368  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3543  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.16 
 
 		 659 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0796  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.42 
 
 		 765 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.341606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1509  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.52 
 
 		 571 aa  122  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44121  normal  0.0349148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1578  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.72 
 
 		 631 aa  120  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1034  diguanylate cyclase  42.04 
 
 		 283 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3055  sensory box-containing protein  39.88 
 
 		 847 aa  120  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.22 
 
 		 722 aa  120  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.95 
 
 		 664 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1779  diguanylate cyclase  39.22 
 
 		 215 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1891  GGDEF family protein  36.79 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0989332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3221  sensory box-containing diguanylate cyclase  45.75 
 
 		 858 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1618  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.04 
 
 		 315 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.465864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0693  diguanylate cyclase  30.06 
 
 		 389 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2209  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.55 
 
 		 844 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3975  GGDEF  40.34 
 
 		 523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.456822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.55 
 
 		 693 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2664  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.16 
 
 		 1063 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.07 
 
 		 728 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0172  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.02 
 
 		 685 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1154  sensory box protein  48.37 
 
 		 861 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369215  normal  0.176732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3694  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.35 
 
 		 664 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.06 
 
 		 664 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.92 
 
 		 1244 aa  118  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3547  diguanylate cyclase  44.1 
 
 		 314 aa  118  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2737  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.62 
 
 		 951 aa  118  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000925868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0693  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.35 
 
 		 664 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 		 802 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1078  diguanylate cyclase  41.14 
 
 		 283 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.239628  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2940  sensor diguanylate cyclase  26.41 
 
 		 571 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0760  diguanylate cyclase  40.8 
 
 		 495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.126237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2393  signal transduction protein  32.19 
 
 		 817 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.512634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000161  GGDEF family protein  42.42 
 
 		 652 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46573  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1378  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.76 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0221  GGDEF domain-containing protein  36.47 
 
 		 710 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0896  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.76 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.225893  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1506  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.79 
 
 		 794 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.176969  normal  0.629284 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4948  sensory box protein  40.12 
 
 		 921 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2024  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.97 
 
 		 665 aa  117  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  38.33 
 
 		 1093 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1188  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  48.37 
 
 		 861 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.179434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4106  GGDEF domain/EAL domain protein  39.74 
 
 		 756 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624649  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1089  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40 
 
 		 667 aa  117  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.973751  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.94 
 
 		 577 aa  117  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3545  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.15 
 
 		 569 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3523  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.41 
 
 		 872 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.738639 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8066  hypothetical protein  36.72 
 
 		 314 aa  117  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0556463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0430  GGDEF domain-containing protein  42.21 
 
 		 532 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3182  GGDEF domain-containing protein  41.18 
 
 		 754 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0508  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.68 
 
 		 917 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0729931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1356  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.04 
 
 		 399 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3581  GGDEF domain-containing protein  33.82 
 
 		 695 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3217  signal transduction protein  39.41 
 
 		 951 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00711667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.89 
 
 		 1505 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.40172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>