115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5251 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5251  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  726    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1691  hypothetical protein  52.84 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.06847  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0782  hypothetical protein  39.29 
 
 		 431 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0559  hypothetical protein  36.31 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1297  hypothetical protein  37.91 
 
 		 431 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4232  hypothetical protein  34.97 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.183267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4794  hypothetical protein  33.33 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0835989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0889  hypothetical protein  29.87 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  24.27 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  21.64 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4700  hypothetical protein  31.68 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829428  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  25.71 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  22.97 
 
 		 504 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  23.31 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  19.62 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  20 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  23.26 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  29.8 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  22.15 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.63 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  27.03 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  22.16 
 
 		 379 aa  57  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  26.49 
 
 		 509 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  23.79 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.66 
 
 		 447 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  24.24 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  27.7 
 
 		 434 aa  54.3  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.52 
 
 		 511 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.92 
 
 		 468 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.47 
 
 		 447 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  24.18 
 
 		 424 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  20.42 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  20.16 
 
 		 420 aa  52.8  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  27.97 
 
 		 414 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  22.31 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  24.32 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  22.58 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.2 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  27.97 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  25.17 
 
 		 508 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  24.46 
 
 		 498 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  20.65 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0656  bacteriocin ABC transporter, putative  20.27 
 
 		 370 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2243  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.33 
 
 		 403 aa  49.7  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  25.97 
 
 		 442 aa  49.7  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.97 
 
 		 442 aa  49.7  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  19.34 
 
 		 429 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  19.34 
 
 		 429 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.46 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  28.99 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.87 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.38 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  23.81 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  19.79 
 
 		 498 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.47 
 
 		 466 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  24.25 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  25.58 
 
 		 498 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  31.97 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  24.49 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  23.81 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  27.52 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  34.25 
 
 		 541 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.52 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  26.72 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.43 
 
 		 473 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  20.9 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.83 
 
 		 441 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  34.88 
 
 		 541 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  26.24 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  26.19 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0056  putative type I secretion protein, HlyD family  22.97 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  28.81 
 
 		 457 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.83 
 
 		 473 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.2 
 
 		 451 aa  46.2  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  23.6 
 
 		 387 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2264  hypothetical protein  26.03 
 
 		 627 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  26.38 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  28.47 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1083  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  25.84 
 
 		 500 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.102695  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1163  secretion protein HlyD family protein  24.59 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.54 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  23.11 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  25.64 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  23.11 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  23.11 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.38 
 
 		 475 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  26.73 
 
 		 523 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  24.16 
 
 		 538 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28 
 
 		 472 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  23.89 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.64 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  20 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  22.05 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1094  secretion protein HlyD family protein  24.3 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  22.08 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  28.47 
 
 		 457 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  26.43 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  26.43 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.45 
 
 		 455 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>