More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1103 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  49.57 
 
 		 1073 aa  974    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  41.49 
 
 		 1022 aa  701    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  41.29 
 
 		 1063 aa  741    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  43.01 
 
 		 1135 aa  759    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  49.27 
 
 		 1038 aa  947    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1138 aa  2303    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  48.4 
 
 		 1165 aa  1043    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  37.59 
 
 		 1142 aa  733    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  47.86 
 
 		 1043 aa  926    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  38.23 
 
 		 1153 aa  751    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  38.18 
 
 		 1033 aa  635  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  36.6 
 
 		 1147 aa  625  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  36.71 
 
 		 1051 aa  619  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  37.94 
 
 		 1036 aa  614  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  36.34 
 
 		 1032 aa  592  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  35.32 
 
 		 1059 aa  562  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  34.87 
 
 		 1031 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  35.89 
 
 		 1028 aa  546  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  34.33 
 
 		 1065 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1129 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1040 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  34.37 
 
 		 1105 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 1063 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 1093 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  31.96 
 
 		 1058 aa  500  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1065 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1038 aa  499  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1234 aa  496  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 1166 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1127 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1074 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1059 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 1051 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1163 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 		 1081 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 1033 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1169 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1087 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1189 aa  469  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1043 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  31.04 
 
 		 1071 aa  460  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 1067 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1071 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1186 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1072 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 		 1071 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 1098 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 1039 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1064 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1068 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1081 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  31.72 
 
 		 1083 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1059 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 1101 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1041 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  32 
 
 		 1010 aa  416  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1176 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1011 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1081 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 1047 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1153 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1073 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1088 aa  390  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 1050 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1044 aa  386  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 1078 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1099 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1115 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 		 1098 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1107 aa  367  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1138 aa  360  8e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1137 aa  347  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 1008 aa  343  1e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.84 
 
 		 1025 aa  326  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1155 aa  325  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1027 aa  321  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 		 1117 aa  310  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1084 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 1128 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1114 aa  307  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1088 aa  306  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 1116 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1057 aa  300  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 1122 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1177 aa  295  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1152 aa  294  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1177 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 1097 aa  291  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1102 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1148 aa  284  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1155 aa  283  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1129 aa  280  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1102 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1096 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 1037 aa  271  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 1189 aa  270  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 1043 aa  265  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1066 aa  264  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 962 aa  264  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1161 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>