More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3319 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  81.96 
 
 		 205 aa  333  7e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  74.63 
 
 		 205 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  74.63 
 
 		 205 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  74.63 
 
 		 205 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  78.53 
 
 		 204 aa  320  7e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  73.66 
 
 		 205 aa  317  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
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NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  73.66 
 
 		 205 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  73.66 
 
 		 205 aa  313  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  71.71 
 
 		 205 aa  310  6.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  70.31 
 
 		 205 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  74.86 
 
 		 207 aa  295  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  68.91 
 
 		 205 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  65.37 
 
 		 204 aa  262  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  64.95 
 
 		 205 aa  260  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  62.89 
 
 		 204 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  65.38 
 
 		 204 aa  240  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  57.07 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
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NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  57.07 
 
 		 204 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
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NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  63.04 
 
 		 205 aa  237  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  61.96 
 
 		 204 aa  234  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  59.67 
 
 		 204 aa  227  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 205 aa  217  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 202 aa  194  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
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NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
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NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  33.13 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
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NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
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NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 200 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  28.4 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  29.45 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 400 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  29.53 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
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NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  28.47 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
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NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
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NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  22.54 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
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NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 259 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
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