217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1561 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  100 
 
 
502 aa  993    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  40.63 
 
 
516 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  38.18 
 
 
551 aa  303  7.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  37.2 
 
 
544 aa  302  8.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  37.15 
 
 
548 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  37.06 
 
 
551 aa  266  7e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  32.81 
 
 
533 aa  257  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  31.75 
 
 
558 aa  210  6e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  30.13 
 
 
541 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  29.84 
 
 
490 aa  180  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  29.18 
 
 
551 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  43.08 
 
 
203 aa  136  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  31.11 
 
 
524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  30.12 
 
 
510 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  28.82 
 
 
517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  30.84 
 
 
607 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  32.39 
 
 
334 aa  124  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  31.25 
 
 
517 aa  123  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  28.63 
 
 
514 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  28.09 
 
 
514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  30.6 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  28.6 
 
 
514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  28.6 
 
 
514 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  39.8 
 
 
205 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  27.89 
 
 
514 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  28.11 
 
 
500 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  28.69 
 
 
516 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  34.68 
 
 
307 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  37.95 
 
 
220 aa  104  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  34.58 
 
 
248 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  29.33 
 
 
492 aa  95.9  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  26.94 
 
 
471 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  28.57 
 
 
1078 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  29.16 
 
 
759 aa  93.6  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  28.74 
 
 
1078 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  34.38 
 
 
974 aa  90.5  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  26.84 
 
 
1079 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  29.09 
 
 
475 aa  87.8  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  25.95 
 
 
835 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  23.03 
 
 
749 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  26.06 
 
 
765 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  28.95 
 
 
521 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  25.29 
 
 
508 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  28.02 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  27.35 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  28.06 
 
 
510 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  28.06 
 
 
521 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  24.44 
 
 
837 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
304 aa  72.8  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  26.56 
 
 
527 aa  71.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  35.96 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  31.14 
 
 
520 aa  70.5  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  24.25 
 
 
844 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  25.78 
 
 
504 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  26.2 
 
 
504 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  25.6 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2430  Spermine synthase  23.38 
 
 
529 aa  68.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514854  hitchhiker  0.00202916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  27.36 
 
 
514 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  33.87 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  25.34 
 
 
498 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  25.97 
 
 
504 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  25.96 
 
 
283 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  24.2 
 
 
876 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3029  hypothetical protein  33.12 
 
 
188 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  25.78 
 
 
503 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  38.81 
 
 
280 aa  66.6  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  23.92 
 
 
782 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  27.3 
 
 
520 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  28.34 
 
 
251 aa  65.1  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  25.46 
 
 
819 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  25.22 
 
 
803 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  25.84 
 
 
503 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0159  hypothetical protein  32.46 
 
 
254 aa  64.7  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0669306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  24.42 
 
 
991 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  25.6 
 
 
283 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  26.12 
 
 
536 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  25 
 
 
525 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  25 
 
 
525 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  24.27 
 
 
525 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  25.34 
 
 
504 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  25.34 
 
 
504 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  25.34 
 
 
504 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  26.42 
 
 
520 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  26.42 
 
 
520 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  25.06 
 
 
510 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  28.44 
 
 
523 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  31.55 
 
 
522 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  28.66 
 
 
538 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  24.11 
 
 
836 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  26.27 
 
 
982 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  25.42 
 
 
765 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  36.8 
 
 
304 aa  60.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  32.61 
 
 
316 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  31.25 
 
 
310 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  27.27 
 
 
259 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  24.71 
 
 
758 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  24.24 
 
 
533 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  26.19 
 
 
759 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  26.24 
 
 
830 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  29.01 
 
 
759 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>