149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1543 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 416 aa  783    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  42.61 
 
 		 392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  36.87 
 
 		 417 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  34.69 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  33.51 
 
 		 411 aa  156  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  35.61 
 
 		 416 aa  155  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 464 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 429 aa  150  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  35.04 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  31.75 
 
 		 409 aa  144  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  35.61 
 
 		 395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  36.24 
 
 		 417 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  34.01 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 414 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  35.68 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  34.53 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  34.62 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  31.86 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  32.66 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  37.98 
 
 		 458 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  34.63 
 
 		 495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  34.48 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  33.7 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  36.14 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  32.68 
 
 		 420 aa  90.1  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.7 
 
 		 601 aa  62.4  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 552 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  42.67 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  42.05 
 
 		 485 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.7 
 
 		 501 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  42.31 
 
 		 486 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  36.56 
 
 		 520 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  34.59 
 
 		 502 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.59 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.59 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  34.27 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  37.04 
 
 		 547 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  28.16 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  46.34 
 
 		 483 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  38.96 
 
 		 498 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  31.85 
 
 		 514 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  34.56 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  31.3 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  47.46 
 
 		 554 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  47.46 
 
 		 554 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  43.42 
 
 		 562 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  47.46 
 
 		 554 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  39.74 
 
 		 501 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  42.19 
 
 		 460 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  35.56 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  39.56 
 
 		 515 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  28.75 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  30.04 
 
 		 498 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  39.47 
 
 		 525 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 312 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  37.65 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  44.16 
 
 		 481 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  32.1 
 
 		 558 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  34.29 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 659 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 597 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  37.21 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  30.46 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  35.85 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  34.21 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  34.21 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  34.21 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 564 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.37 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  34.21 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.21 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  34.38 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.21 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.21 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  28.53 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  37.1 
 
 		 555 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  28.5 
 
 		 518 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  40.7 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  36.9 
 
 		 528 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  40.32 
 
 		 525 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  30.26 
 
 		 602 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  31.03 
 
 		 542 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  31.29 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  35.42 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 462 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  32.88 
 
 		 493 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  41.38 
 
 		 547 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  29.89 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  45.76 
 
 		 525 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  28.18 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  52.83 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  34.57 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  31.17 
 
 		 740 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  38.46 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  40.91 
 
 		 540 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  36.21 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  36.46 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  27.74 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>