160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2110 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2110  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 476 aa  971    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  30.74 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  25.49 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 510 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 466 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  23.82 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 479 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 527 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 493 aa  76.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  23.16 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  23.3 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  22.71 
 
 		 502 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  27.18 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  27.04 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  27.94 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 488 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  23.23 
 
 		 511 aa  70.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.73 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  25.39 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  28.16 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 631 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 573 aa  67.4  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  23.18 
 
 		 484 aa  67  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 511 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  24.76 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 547 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 541 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  23.84 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 507 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.69 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  27.9 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.08 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  22.25 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  23.2 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  23.68 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 548 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  29.9 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  25.13 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 620 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 447 aa  57  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  28.77 
 
 		 456 aa  57  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 500 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 601 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  23.95 
 
 		 489 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 480 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 506 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1782  RagB/SusD domain protein  21.5 
 
 		 510 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 512 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  24.65 
 
 		 476 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  23.38 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  22.22 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 613 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 557 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 506 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  24.81 
 
 		 604 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 511 aa  54.3  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 485 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  33.11 
 
 		 507 aa  53.9  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 486 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  23.23 
 
 		 519 aa  53.9  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 472 aa  53.5  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 488 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 491 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 542 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  30.63 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>