104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4101 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  400  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4102  TetR family transcriptional regulator  62.15 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0933  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 196 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2085  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.839417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3894  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1181  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000866899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1816  TetR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.136235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  37.39 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  35 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 257 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  28.68 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 260 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  20.41 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 357 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  29.06 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  18.56 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  17.53 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  17.53 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 254 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 189 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  42  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 228 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 203 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 224 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  42.62 
 
 		 208 aa  42  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  29.94 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 254 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 181 aa  42  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 220 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 225 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 261 aa  41.6  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 168 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 202 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  41.6  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 179 aa  41.6  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 249 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>