99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4102 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4102  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  62.63 
 
 		 204 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0933  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 196 aa  142  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2085  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.839417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3894  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1181  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000866899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1816  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.136235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32400  transcriptional regulator, tetR family  39.74 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 168 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 357 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 257 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  32.91 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  28.89 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 244 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  30.71 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  30.66 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 234 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  28.09 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 229 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 222 aa  44.7  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  34.17 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  39.19 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 261 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 260 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 205 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 215 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 189 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 216 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 178 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 188 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 211 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 210 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 175 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 206 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 187 aa  42  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  36.11 
 
 		 214 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 189 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 258 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  32.76 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 188 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 219 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 180 aa  41.2  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>