101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1816 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1816  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.136235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1181  transcriptional regulator, TetR family  86.27 
 
 		 204 aa  313  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000866899  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0933  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4102  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2085  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 202 aa  94.7  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.839417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3894  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  33.75 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 357 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 168 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  33.02 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 257 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  42.86 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  36.05 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 477 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 477 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  38.96 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  30.15 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  31.67 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0986  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3453  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  32.1 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  32.1 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 195 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 280 aa  42.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  42  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 189 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 200 aa  42  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 236 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 187 aa  42  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  35.62 
 
 		 197 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  36.99 
 
 		 235 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 228 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 234 aa  41.6  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 244 aa  41.2  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 181 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 216 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>