53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0933 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0933  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2085  TetR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.839417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3894  TetR family transcriptional regulator  51.74 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4102  TetR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1181  transcriptional regulator, TetR family  38.15 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000866899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1816  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.136235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 239 aa  44.7  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  27.5 
 
 		 220 aa  44.7  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  32.91 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 227 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 357 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 178 aa  42  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1729  nucleoid occlusion protein  27.47 
 
 		 216 aa  42  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 257 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  27 
 
 		 232 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 180 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 212 aa  42  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  23.81 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 224 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2012  nucleoid occlusion protein  27.47 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 218 aa  41.2  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  33.01 
 
 		 202 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  37.66 
 
 		 179 aa  41.2  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 141 aa  41.2  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>