47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2085 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2085  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.839417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0933  TetR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3894  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 219 aa  160  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4102  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1181  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000866899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1816  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.136235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6449  nucleoid occlusion protein  29.55 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2484  nucleoid occlusion protein  29.77 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3098  nucleoid occlusion protein  29.77 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170288  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  32.89 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3114  nucleoid occlusion protein  29.77 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  30.61 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 179 aa  45.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 217 aa  44.7  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 141 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3145  nucleoid occlusion protein  31.13 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3007  nucleoid occlusion protein  27.69 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  30.85 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3979  nucleoid occlusion protein  32.89 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 227 aa  42  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0182  nucleoid occlusion protein  29.77 
 
 		 220 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847466  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  26.55 
 
 		 198 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 186 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 227 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  27.62 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 239 aa  41.6  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 227 aa  41.2  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>