190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4285 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4285  cellulose-binding family II  100 
 
 		 472 aa  937    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  50.82 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  48.15 
 
 		 1137 aa  79.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  45 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  47.5 
 
 		 778 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  48.15 
 
 		 763 aa  76.6  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  48.15 
 
 		 1298 aa  76.6  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  43.75 
 
 		 562 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  43.3 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  38.66 
 
 		 847 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  50 
 
 		 775 aa  75.1  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  46.25 
 
 		 1209 aa  73.6  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  39.83 
 
 		 688 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  42 
 
 		 474 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  39.09 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  47.5 
 
 		 518 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  38.66 
 
 		 609 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  47.5 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.3 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  43.75 
 
 		 533 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  40.48 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  51.43 
 
 		 727 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  35.42 
 
 		 846 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  42.86 
 
 		 1007 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  46.67 
 
 		 938 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  44.05 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  41.75 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  39.8 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  34.09 
 
 		 851 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  32.37 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  37.12 
 
 		 794 aa  67  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  37.25 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  38.61 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  48.75 
 
 		 1121 aa  65.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  35.71 
 
 		 913 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  37.04 
 
 		 925 aa  64.7  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.5 
 
 		 867 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  26.97 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  40.21 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  38.75 
 
 		 743 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  38.24 
 
 		 590 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  37.78 
 
 		 608 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  38.75 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  32.94 
 
 		 942 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  37.11 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  31.71 
 
 		 812 aa  63.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  35.71 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  40.24 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.1 
 
 		 998 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  35.56 
 
 		 864 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  46.67 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  42.67 
 
 		 487 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  39.56 
 
 		 1042 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  38.1 
 
 		 791 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  39.78 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  41.49 
 
 		 699 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  35.48 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  38.71 
 
 		 694 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  36.19 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  43.66 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  34.02 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  50.67 
 
 		 973 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  36.11 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  41.25 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 628 aa  60.1  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  41.77 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.78 
 
 		 984 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  39.29 
 
 		 880 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  37.35 
 
 		 364 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  23.72 
 
 		 351 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  33.98 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  39.53 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  40 
 
 		 773 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.51 
 
 		 588 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  37.35 
 
 		 673 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  37.35 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  38.89 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  38.27 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  39.76 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.03 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  36.17 
 
 		 875 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  35 
 
 		 906 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  38.24 
 
 		 725 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  35.83 
 
 		 963 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  37.63 
 
 		 605 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  33.01 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  35.29 
 
 		 580 aa  57.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  38.37 
 
 		 700 aa  57.4  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  36.47 
 
 		 656 aa  57.4  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  36.47 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  40.66 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.74 
 
 		 633 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 		 589 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  37.93 
 
 		 593 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  35.29 
 
 		 596 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  39.18 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  28.7 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  31.07 
 
 		 621 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  39.76 
 
 		 767 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>