More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1848 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1054 aa  2116    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 		 1121 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  34.09 
 
 		 1032 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  34.71 
 
 		 1038 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  34.14 
 
 		 1052 aa  598  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  30.64 
 
 		 1042 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1063 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  31.83 
 
 		 1063 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1063 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1063 aa  569  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1034 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1063 aa  561  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.06 
 
 		 1067 aa  559  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  33.59 
 
 		 1044 aa  557  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1067 aa  555  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1067 aa  556  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  31.25 
 
 		 1067 aa  555  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  32.32 
 
 		 1049 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1048 aa  551  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.86 
 
 		 1067 aa  552  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1055 aa  545  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1050 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  32.42 
 
 		 1039 aa  538  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.56 
 
 		 1041 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1051 aa  530  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 		 1053 aa  528  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 		 1069 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1060 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  31.35 
 
 		 1075 aa  482  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.71 
 
 		 1060 aa  471  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.07 
 
 		 1074 aa  464  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  29.48 
 
 		 1060 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  28.85 
 
 		 1040 aa  462  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  29.64 
 
 		 1052 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1053 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  29.44 
 
 		 1073 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  29.94 
 
 		 1050 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  29.24 
 
 		 1057 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 		 1041 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  29.82 
 
 		 1053 aa  455  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1074 aa  455  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  29.16 
 
 		 1053 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1054 aa  450  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  29.2 
 
 		 1061 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  29.39 
 
 		 1062 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  29.26 
 
 		 1056 aa  444  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1041 aa  446  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1041 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 		 1053 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  28.59 
 
 		 1054 aa  436  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1033 aa  436  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1050 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1033 aa  436  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  29.89 
 
 		 1066 aa  436  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1098 aa  430  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  27.77 
 
 		 1068 aa  432  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  27.99 
 
 		 1036 aa  426  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  27.82 
 
 		 1034 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  29.08 
 
 		 1060 aa  422  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.01 
 
 		 1093 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1043 aa  412  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 		 1035 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1064 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  29.1 
 
 		 1071 aa  408  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  28.08 
 
 		 1072 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  27.45 
 
 		 1033 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1063 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1030 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  28.88 
 
 		 1048 aa  399  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 		 1048 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  24.15 
 
 		 1035 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  25.32 
 
 		 1131 aa  340  8e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1035 aa  327  8.000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1030 aa  317  6e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  27.88 
 
 		 1135 aa  317  7e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  25.23 
 
 		 1137 aa  307  7e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1034 aa  300  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  25.25 
 
 		 1092 aa  298  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.42 
 
 		 1044 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  24.37 
 
 		 1044 aa  290  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  24.46 
 
 		 1011 aa  289  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  23.52 
 
 		 1050 aa  288  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  25.07 
 
 		 1038 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1043 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  24.01 
 
 		 1044 aa  284  6.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  25.27 
 
 		 1069 aa  274  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  25.27 
 
 		 1043 aa  273  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  24.11 
 
 		 1143 aa  271  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  23.85 
 
 		 1034 aa  269  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  24.3 
 
 		 1040 aa  269  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  25.65 
 
 		 1005 aa  267  7e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  24.01 
 
 		 1470 aa  266  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  23.72 
 
 		 1049 aa  265  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  23.62 
 
 		 1043 aa  263  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  24.46 
 
 		 1191 aa  259  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  23.96 
 
 		 1070 aa  258  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1048 aa  257  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  24.58 
 
 		 1146 aa  255  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  24.13 
 
 		 1057 aa  254  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  23.73 
 
 		 1052 aa  251  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>