219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0321 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  48.41 
 
 		 821 aa  755    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  47.65 
 
 		 823 aa  683    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  47.1 
 
 		 823 aa  673    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  44.25 
 
 		 824 aa  707    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  100 
 
 		 813 aa  1630    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  42.18 
 
 		 828 aa  636    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  54.29 
 
 		 815 aa  864    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  53.08 
 
 		 816 aa  874    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  56.34 
 
 		 821 aa  916    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  47.48 
 
 		 823 aa  677    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  39.23 
 
 		 835 aa  610  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  36.77 
 
 		 825 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  36.04 
 
 		 872 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  33.99 
 
 		 859 aa  466  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  32.39 
 
 		 807 aa  415  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  30.56 
 
 		 800 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  24.15 
 
 		 755 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  23.43 
 
 		 778 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.9 
 
 		 764 aa  174  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  20.59 
 
 		 815 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  23.02 
 
 		 808 aa  157  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.43 
 
 		 807 aa  151  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  21.31 
 
 		 788 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  25.44 
 
 		 1051 aa  142  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  22.65 
 
 		 788 aa  140  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.92 
 
 		 837 aa  139  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.52 
 
 		 773 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.44 
 
 		 831 aa  131  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  22.19 
 
 		 764 aa  131  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.45 
 
 		 806 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  21.34 
 
 		 905 aa  126  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  21.26 
 
 		 779 aa  126  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  20.99 
 
 		 801 aa  126  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  23.62 
 
 		 751 aa  125  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  21.62 
 
 		 756 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  21.68 
 
 		 860 aa  122  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  19.01 
 
 		 800 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  20.6 
 
 		 811 aa  116  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.6 
 
 		 789 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.55 
 
 		 967 aa  116  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  20.7 
 
 		 865 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  23.52 
 
 		 804 aa  112  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  20.73 
 
 		 792 aa  111  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  23.02 
 
 		 763 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  22.03 
 
 		 767 aa  109  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  21.38 
 
 		 789 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.81 
 
 		 762 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  20.58 
 
 		 803 aa  105  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1083 aa  103  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  20.25 
 
 		 797 aa  103  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  21.62 
 
 		 778 aa  102  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  20.44 
 
 		 797 aa  96.3  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  20.63 
 
 		 796 aa  95.1  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  20.19 
 
 		 788 aa  95.5  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  21.53 
 
 		 789 aa  94.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  19.75 
 
 		 788 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  23.54 
 
 		 898 aa  92.4  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  20 
 
 		 779 aa  91.7  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  20.95 
 
 		 727 aa  89.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  22.57 
 
 		 805 aa  87  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  24.37 
 
 		 694 aa  87  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2688  RND superfamily transporter  20.48 
 
 		 787 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  22.71 
 
 		 881 aa  85.9  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.34 
 
 		 717 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  19.26 
 
 		 784 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  20.85 
 
 		 694 aa  82.8  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  22.78 
 
 		 692 aa  80.9  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  20.13 
 
 		 748 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.35 
 
 		 758 aa  79.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  20.07 
 
 		 785 aa  80.1  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  24.31 
 
 		 861 aa  77.8  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  20.65 
 
 		 772 aa  77.4  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  20.34 
 
 		 755 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  19.23 
 
 		 765 aa  77  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  24.39 
 
 		 385 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  20.03 
 
 		 1011 aa  76.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  20.64 
 
 		 830 aa  75.5  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.93 
 
 		 747 aa  75.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  22.62 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0528  RND superfamily transporter  20.48 
 
 		 789 aa  75.1  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  19.45 
 
 		 889 aa  75.1  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  22.85 
 
 		 1359 aa  74.3  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  19.9 
 
 		 767 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  20.79 
 
 		 771 aa  73.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  27.95 
 
 		 879 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  20.35 
 
 		 385 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  28.12 
 
 		 380 aa  72  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.26 
 
 		 746 aa  72  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  20.32 
 
 		 770 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  19.72 
 
 		 752 aa  71.2  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  19.24 
 
 		 772 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  19.12 
 
 		 864 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  27.17 
 
 		 923 aa  68.6  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  22.2 
 
 		 768 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  21.02 
 
 		 674 aa  68.2  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  20.75 
 
 		 796 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  20.49 
 
 		 768 aa  67  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.14 
 
 		 776 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  18.02 
 
 		 799 aa  67.4  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  17.42 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>