More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3269 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I3269  phage-related secreted protein  100 
 
 		 460 aa  914    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3908  Type II secretory pathway, component PulD  76.41 
 
 		 448 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2981  Type II secretory pathway, component PulD  47.25 
 
 		 394 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281289  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2071  type II and III secretion system protein  32.3 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1698  type II/III secretion system protein  32.31 
 
 		 406 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1457  type II and III secretion system protein  30.46 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447998  normal  0.0646338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  26.54 
 
 		 681 aa  96.7  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  25.29 
 
 		 696 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  26.39 
 
 		 797 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  24.81 
 
 		 794 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  29.85 
 
 		 807 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  35.67 
 
 		 656 aa  80.9  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2608  general secretion pathway protein D  27.34 
 
 		 842 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  25.97 
 
 		 752 aa  77.4  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  25 
 
 		 703 aa  77.8  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  30.17 
 
 		 756 aa  77.4  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  30.59 
 
 		 803 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  28.23 
 
 		 754 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  31.85 
 
 		 653 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  25.1 
 
 		 812 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2468  type II and III secretion system protein  37.76 
 
 		 625 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.679634  normal  0.597766 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  28.82 
 
 		 805 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  25.97 
 
 		 803 aa  74.7  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2459  type II and III secretion system protein  37.59 
 
 		 621 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3478  type II and III secretion system protein  37.32 
 
 		 621 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883707  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2293  type II and III secretion system protein  37.32 
 
 		 621 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  28.98 
 
 		 760 aa  73.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  22.74 
 
 		 744 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  25.27 
 
 		 777 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29100  type II and III secretion system protein  31.06 
 
 		 614 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0223781  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  25.97 
 
 		 801 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  25.27 
 
 		 771 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1622  type II and III secretion system protein  24.26 
 
 		 673 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  23.34 
 
 		 757 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  23.34 
 
 		 757 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  26.47 
 
 		 767 aa  71.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  23.34 
 
 		 757 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  23.34 
 
 		 757 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  23.34 
 
 		 757 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1987  type II and III secretion system protein  35.66 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0115184  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  23.34 
 
 		 757 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  23.34 
 
 		 750 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1284  type II and III secretion system protein  30.77 
 
 		 868 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  25.98 
 
 		 686 aa  70.5  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  29.55 
 
 		 783 aa  70.1  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  28.16 
 
 		 784 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  32.53 
 
 		 772 aa  69.7  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  28.76 
 
 		 645 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  31.4 
 
 		 667 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  26.99 
 
 		 747 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2999  type II and III secretion system protein  30.22 
 
 		 870 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  27.5 
 
 		 697 aa  68.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  25.18 
 
 		 789 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  28.16 
 
 		 779 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  28.42 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  27.81 
 
 		 780 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  27.88 
 
 		 711 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003452  putative maturation protein  26.75 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.171199  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  25.58 
 
 		 720 aa  68.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  27.63 
 
 		 658 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1778  type II secretion system protein, putative  27.5 
 
 		 822 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0505418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  28 
 
 		 733 aa  67.8  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  26.16 
 
 		 672 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  25.75 
 
 		 829 aa  67.4  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  27.47 
 
 		 776 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  25 
 
 		 1421 aa  66.6  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  25.89 
 
 		 810 aa  66.6  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  26.41 
 
 		 763 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  28.57 
 
 		 658 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  29.48 
 
 		 774 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1469  type II and III secretion system protein  28.21 
 
 		 792 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  27.07 
 
 		 776 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  29.48 
 
 		 774 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  26.48 
 
 		 833 aa  65.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1859  type II and III secretion system protein  28.21 
 
 		 861 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.765108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1462  type II and III secretion system protein  28.21 
 
 		 769 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1929  type II and III secretion system protein  28.21 
 
 		 796 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.114575  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  23.59 
 
 		 780 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  25.76 
 
 		 793 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  25.88 
 
 		 819 aa  65.1  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  28.14 
 
 		 751 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  24.42 
 
 		 641 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  27.45 
 
 		 655 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  27.12 
 
 		 733 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2583  type II and III secretion system protein  28.66 
 
 		 749 aa  64.3  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  27.81 
 
 		 635 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  32.39 
 
 		 682 aa  64.7  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  31.25 
 
 		 689 aa  64.3  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  27.78 
 
 		 630 aa  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  23.51 
 
 		 781 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  27.74 
 
 		 675 aa  63.9  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  24.53 
 
 		 738 aa  63.9  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  26.45 
 
 		 783 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  26.62 
 
 		 657 aa  63.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  29.79 
 
 		 750 aa  63.5  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  27.07 
 
 		 803 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  27.07 
 
 		 803 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  26.59 
 
 		 717 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  24.69 
 
 		 634 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  27.53 
 
 		 636 aa  63.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>