More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1698 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1698  type II/III secretion system protein  100 
 
 		 406 aa  818    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2071  type II and III secretion system protein  42.89 
 
 		 388 aa  327  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2981  Type II secretory pathway, component PulD  35.55 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281289  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3908  Type II secretory pathway, component PulD  32.86 
 
 		 448 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3269  phage-related secreted protein  31.94 
 
 		 460 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1457  type II and III secretion system protein  30.27 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447998  normal  0.0646338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  30.56 
 
 		 711 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  29.5 
 
 		 752 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  26.85 
 
 		 681 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  25.24 
 
 		 675 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  29.57 
 
 		 756 aa  91.3  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  26.82 
 
 		 696 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  27.44 
 
 		 733 aa  86.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  23.06 
 
 		 672 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  27.4 
 
 		 794 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  24.92 
 
 		 797 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  33.77 
 
 		 803 aa  76.6  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  33.77 
 
 		 801 aa  76.6  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  22.68 
 
 		 686 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  23.3 
 
 		 689 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  26.8 
 
 		 829 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  28.79 
 
 		 686 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  28.79 
 
 		 686 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  28.79 
 
 		 686 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  28.79 
 
 		 686 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  30.57 
 
 		 805 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  28.98 
 
 		 780 aa  73.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  26.95 
 
 		 584 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  25.79 
 
 		 819 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  30.61 
 
 		 745 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  27.33 
 
 		 720 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  27.67 
 
 		 793 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  26.11 
 
 		 584 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  24.56 
 
 		 635 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  26.87 
 
 		 784 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  22.94 
 
 		 799 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  26.79 
 
 		 810 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  26.23 
 
 		 630 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  26.51 
 
 		 736 aa  70.1  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  29.32 
 
 		 658 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  22.68 
 
 		 703 aa  70.1  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  26.29 
 
 		 751 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  26.82 
 
 		 763 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  22.61 
 
 		 660 aa  69.3  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  27.64 
 
 		 807 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  27.36 
 
 		 779 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  26.7 
 
 		 751 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  24.63 
 
 		 775 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1622  type II and III secretion system protein  23.97 
 
 		 673 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  27.68 
 
 		 640 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  22.99 
 
 		 781 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  26.9 
 
 		 803 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  27.68 
 
 		 640 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  28.74 
 
 		 702 aa  67.8  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  24.63 
 
 		 775 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1284  type II and III secretion system protein  21.31 
 
 		 868 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  27.68 
 
 		 640 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  22.22 
 
 		 777 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  21.32 
 
 		 670 aa  67  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  32.34 
 
 		 656 aa  67  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  22.22 
 
 		 771 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  23.79 
 
 		 774 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  23.79 
 
 		 774 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1211  type II and III secretion system protein  24.79 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  26.88 
 
 		 632 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  26.29 
 
 		 697 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  25.84 
 
 		 776 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  24.88 
 
 		 740 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  22.43 
 
 		 640 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  22.93 
 
 		 640 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  22.64 
 
 		 706 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  28.99 
 
 		 717 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  29.81 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  25.9 
 
 		 787 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0190  type II and III secretion system protein  24.37 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  25.57 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  26.95 
 
 		 681 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  26.92 
 
 		 686 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  22.18 
 
 		 655 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  22.99 
 
 		 780 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  25.14 
 
 		 655 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  23.18 
 
 		 716 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  21.67 
 
 		 674 aa  64.3  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  25.58 
 
 		 641 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  28.57 
 
 		 704 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  26.43 
 
 		 650 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  22.61 
 
 		 700 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  22.61 
 
 		 700 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  22.43 
 
 		 710 aa  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  22.4 
 
 		 705 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  23.1 
 
 		 775 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  28.57 
 
 		 705 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  28.57 
 
 		 703 aa  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  24.85 
 
 		 781 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1043  general secretion pathway protein D  25.94 
 
 		 584 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.795547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  28.57 
 
 		 702 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  28.57 
 
 		 704 aa  63.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  27.49 
 
 		 724 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  26.04 
 
 		 793 aa  63.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  24.28 
 
 		 772 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>