More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1457 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1457  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 395 aa  797    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447998  normal  0.0646338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1698  type II/III secretion system protein  30.43 
 
 		 406 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3908  Type II secretory pathway, component PulD  29.66 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2071  type II and III secretion system protein  32.17 
 
 		 388 aa  201  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3269  phage-related secreted protein  30.95 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2981  Type II secretory pathway, component PulD  28.64 
 
 		 394 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  32.11 
 
 		 711 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  30.12 
 
 		 756 aa  87.4  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  27.84 
 
 		 752 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  30.3 
 
 		 681 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  27.22 
 
 		 675 aa  76.3  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  37.59 
 
 		 686 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  29.92 
 
 		 773 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  26.67 
 
 		 658 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  27.04 
 
 		 803 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  27.04 
 
 		 801 aa  73.6  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  27.62 
 
 		 672 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  31.29 
 
 		 697 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  31.98 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  26.51 
 
 		 833 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  28.38 
 
 		 1421 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  24.25 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  31.33 
 
 		 584 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  28.33 
 
 		 812 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  24.71 
 
 		 634 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  30.72 
 
 		 584 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 733 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  26.6 
 
 		 780 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0190  type II and III secretion system protein  26.36 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1211  type II and III secretion system protein  25.1 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  26.15 
 
 		 681 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  28.38 
 
 		 630 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  26.22 
 
 		 751 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  26.02 
 
 		 793 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  25.29 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  25.57 
 
 		 776 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  31.71 
 
 		 689 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  25.76 
 
 		 635 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  25.28 
 
 		 819 aa  67  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 460 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  27.7 
 
 		 748 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 460 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  26.12 
 
 		 829 aa  66.6  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  24.5 
 
 		 767 aa  66.2  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  26.01 
 
 		 686 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  26.99 
 
 		 686 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  26.17 
 
 		 758 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  26.99 
 
 		 686 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  26.99 
 
 		 686 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  26.99 
 
 		 686 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  27.98 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  24.19 
 
 		 658 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  23.02 
 
 		 696 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  25.75 
 
 		 779 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  26.35 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  28.92 
 
 		 641 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  27.98 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  28.29 
 
 		 703 aa  64.7  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  27.98 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  27.98 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  27.98 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  27.98 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  26.55 
 
 		 674 aa  64.3  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  27.98 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003452  putative maturation protein  25.11 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.171199  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  25.68 
 
 		 720 aa  64.7  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  26.75 
 
 		 640 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  26.63 
 
 		 799 aa  63.5  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  26.75 
 
 		 640 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  26.75 
 
 		 640 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  27.54 
 
 		 662 aa  63.5  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  31.33 
 
 		 650 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  29.13 
 
 		 797 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1043  general secretion pathway protein D  30.12 
 
 		 584 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.795547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  28.76 
 
 		 704 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  28.76 
 
 		 703 aa  63.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  24.19 
 
 		 658 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  28.82 
 
 		 763 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  27.27 
 
 		 714 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  27.38 
 
 		 751 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  27.54 
 
 		 745 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  29.59 
 
 		 776 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  28.15 
 
 		 794 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  31.39 
 
 		 705 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  28.1 
 
 		 700 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  28.1 
 
 		 700 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  31.16 
 
 		 710 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  27.45 
 
 		 702 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  26.05 
 
 		 805 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  27.45 
 
 		 704 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  27.62 
 
 		 645 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1778  type II secretion system protein, putative  28.76 
 
 		 822 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0505418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2608  general secretion pathway protein D  31.69 
 
 		 842 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  28.1 
 
 		 706 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  28.1 
 
 		 705 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  28.1 
 
 		 705 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  28.22 
 
 		 696 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  29.7 
 
 		 655 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  25.86 
 
 		 530 aa  60.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>